Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FOXD4L3Q6VB84 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FOXD4L3Q6VB84 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FOXD4L3Q6VB84 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FOXD4L3Q6VB84 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FOXD4L3Q6VB84 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FOXD4L3Q6VB84 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FOXD4L3Q6VB84 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FOXD4L3Q6VB84 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FOXD4L3Q6VB84 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FOXD4L3Q6VB84 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FOXD4L3Q6VB84 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FOXD4L3Q6VB84 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
FOXD4L3Q6VB84 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FOXD4L3Q6VB84 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
FOXD4L3Q6VB84 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FOXD4L3Q6VB84 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FOXD4L3Q6VB84 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FOXD4L3Q6VB84 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FOXD4L3Q6VB84 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FOXD4L3Q6VB84 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FOXD4L3Q6VB84 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FOXD4L3Q6VB84 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FOXD4L3Q6VB84 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FOXD4L3Q6VB84 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FOXD4L3Q6VB84 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
FOXD4L3Q6VB84 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FOXD4L3Q6VB84 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FOXD4L3Q6VB84 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FOXD4L3Q6VB84 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FOXD4L3Q6VB84 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FOXD4L3Q6VB84 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FOXD4L3Q6VB84 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FOXD4L3Q6VB84 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FOXD4L3Q6VB84 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FOXD4L3Q6VB84 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
FOXD4L3Q6VB84 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FOXD4L3Q6VB84 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FOXD4L3Q6VB84 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FOXD4L3Q6VB84 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FOXD4L3Q6VB84 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FOXD4L3Q6VB84 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FOXD4L3Q6VB84 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FOXD4L3Q6VB84 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FOXD4L3Q6VB84 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FOXD4L3Q6VB84 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FOXD4L3Q6VB84 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FOXD4L3Q6VB84 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FOXD4L3Q6VB84 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FOXD4L3Q6VB84 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FOXD4L3Q6VB84 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FOXD4L3Q6VB84 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FOXD4L3Q6VB84 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FOXD4L3Q6VB84 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FOXD4L3Q6VB84 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FOXD4L3Q6VB84 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FOXD4L3Q6VB84 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FOXD4L3Q6VB84 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FOXD4L3Q6VB84 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FOXD4L3Q6VB84 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FOXD4L3Q6VB84 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FOXD4L3Q6VB84 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FOXD4L3Q6VB84 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FOXD4L3Q6VB84 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FOXD4L3Q6VB84 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FOXD4L3Q6VB84 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FOXD4L3Q6VB84 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FOXD4L3Q6VB84 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FOXD4L3Q6VB84 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FOXD4L3Q6VB84 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FOXD4L3Q6VB84 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FOXD4L3Q6VB84 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FOXD4L3Q6VB84 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FOXD4L3Q6VB84 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FOXD4L3Q6VB84 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FOXD4L3Q6VB84 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FOXD4L3Q6VB84 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FOXD4L3Q6VB84 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FOXD4L3Q6VB84 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FOXD4L3Q6VB84 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FOXD4L3Q6VB84 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FOXD4L3Q6VB84 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FOXD4L3Q6VB84 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FOXD4L3Q6VB84 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FOXD4L3Q6VB84 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FOXD4L3Q6VB84 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FOXD4L3Q6VB84 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
FOXD4L3Q6VB84 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FOXD4L3Q6VB84 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FOXD4L3Q6VB84 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FOXD4L3Q6VB84 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOXD4L3Q6VB84 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOXD4L3Q6VB84 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOXD4L3Q6VB84 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOXD4L3Q6VB84 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
FOXD4L3Q6VB84 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOXD4L3Q6VB84 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOXD4L3Q6VB84 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOXD4L3Q6VB84 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOXD4L3Q6VB84 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms