Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXZ0

TMIGD1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD1Q6UXZ0 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMIGD1Q6UXZ0 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TMIGD1Q6UXZ0 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TMIGD1Q6UXZ0 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TMIGD1Q6UXZ0 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TMIGD1Q6UXZ0 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TMIGD1Q6UXZ0 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TMIGD1Q6UXZ0 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMIGD1Q6UXZ0 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMIGD1Q6UXZ0 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMIGD1Q6UXZ0 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMIGD1Q6UXZ0 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMIGD1Q6UXZ0 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMIGD1Q6UXZ0 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TMIGD1Q6UXZ0 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMIGD1Q6UXZ0 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMIGD1Q6UXZ0 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMIGD1Q6UXZ0 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMIGD1Q6UXZ0 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMIGD1Q6UXZ0 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMIGD1Q6UXZ0 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMIGD1Q6UXZ0 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMIGD1Q6UXZ0 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMIGD1Q6UXZ0 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMIGD1Q6UXZ0 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TMIGD1Q6UXZ0 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMIGD1Q6UXZ0 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMIGD1Q6UXZ0 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMIGD1Q6UXZ0 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMIGD1Q6UXZ0 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMIGD1Q6UXZ0 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMIGD1Q6UXZ0 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMIGD1Q6UXZ0 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMIGD1Q6UXZ0 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMIGD1Q6UXZ0 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMIGD1Q6UXZ0 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMIGD1Q6UXZ0 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMIGD1Q6UXZ0 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMIGD1Q6UXZ0 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMIGD1Q6UXZ0 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMIGD1Q6UXZ0 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TMIGD1Q6UXZ0 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMIGD1Q6UXZ0 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TMIGD1Q6UXZ0 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMIGD1Q6UXZ0 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMIGD1Q6UXZ0 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMIGD1Q6UXZ0 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMIGD1Q6UXZ0 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMIGD1Q6UXZ0 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMIGD1Q6UXZ0 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMIGD1Q6UXZ0 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TMIGD1Q6UXZ0 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TMIGD1Q6UXZ0 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMIGD1Q6UXZ0 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMIGD1Q6UXZ0 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMIGD1Q6UXZ0 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMIGD1Q6UXZ0 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMIGD1Q6UXZ0 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMIGD1Q6UXZ0 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMIGD1Q6UXZ0 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMIGD1Q6UXZ0 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMIGD1Q6UXZ0 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMIGD1Q6UXZ0 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMIGD1Q6UXZ0 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMIGD1Q6UXZ0 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TMIGD1Q6UXZ0 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMIGD1Q6UXZ0 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TMIGD1Q6UXZ0 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMIGD1Q6UXZ0 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMIGD1Q6UXZ0 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMIGD1Q6UXZ0 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMIGD1Q6UXZ0 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMIGD1Q6UXZ0 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMIGD1Q6UXZ0 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMIGD1Q6UXZ0 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMIGD1Q6UXZ0 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMIGD1Q6UXZ0 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMIGD1Q6UXZ0 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMIGD1Q6UXZ0 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMIGD1Q6UXZ0 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMIGD1Q6UXZ0 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMIGD1Q6UXZ0 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMIGD1Q6UXZ0 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMIGD1Q6UXZ0 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMIGD1Q6UXZ0 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMIGD1Q6UXZ0 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMIGD1Q6UXZ0 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMIGD1Q6UXZ0 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMIGD1Q6UXZ0 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMIGD1Q6UXZ0 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMIGD1Q6UXZ0 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMIGD1Q6UXZ0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMIGD1Q6UXZ0 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMIGD1Q6UXZ0 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMIGD1Q6UXZ0 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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