Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXS9

CASP12, Inactive caspase-12, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP12Q6UXS9 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CASP12Q6UXS9 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CASP12Q6UXS9 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CASP12Q6UXS9 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
CASP12Q6UXS9 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
CASP12Q6UXS9 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CASP12Q6UXS9 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CASP12Q6UXS9 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
CASP12Q6UXS9 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CASP12Q6UXS9 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CASP12Q6UXS9 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CASP12Q6UXS9 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
CASP12Q6UXS9 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
CASP12Q6UXS9 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CASP12Q6UXS9 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CASP12Q6UXS9 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CASP12Q6UXS9 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CASP12Q6UXS9 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CASP12Q6UXS9 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
CASP12Q6UXS9 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CASP12Q6UXS9 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CASP12Q6UXS9 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CASP12Q6UXS9 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CASP12Q6UXS9 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CASP12Q6UXS9 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CASP12Q6UXS9 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CASP12Q6UXS9 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CASP12Q6UXS9 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CASP12Q6UXS9 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CASP12Q6UXS9 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CASP12Q6UXS9 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CASP12Q6UXS9 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CASP12Q6UXS9 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CASP12Q6UXS9 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CASP12Q6UXS9 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CASP12Q6UXS9 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CASP12Q6UXS9 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CASP12Q6UXS9 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CASP12Q6UXS9 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CASP12Q6UXS9 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CASP12Q6UXS9 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CASP12Q6UXS9 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CASP12Q6UXS9 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CASP12Q6UXS9 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CASP12Q6UXS9 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CASP12Q6UXS9 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CASP12Q6UXS9 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CASP12Q6UXS9 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CASP12Q6UXS9 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CASP12Q6UXS9 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CASP12Q6UXS9 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CASP12Q6UXS9 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CASP12Q6UXS9 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CASP12Q6UXS9 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CASP12Q6UXS9 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CASP12Q6UXS9 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CASP12Q6UXS9 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CASP12Q6UXS9 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CASP12Q6UXS9 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CASP12Q6UXS9 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CASP12Q6UXS9 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CASP12Q6UXS9 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CASP12Q6UXS9 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CASP12Q6UXS9 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CASP12Q6UXS9 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CASP12Q6UXS9 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CASP12Q6UXS9 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CASP12Q6UXS9 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CASP12Q6UXS9 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CASP12Q6UXS9 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CASP12Q6UXS9 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CASP12Q6UXS9 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CASP12Q6UXS9 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CASP12Q6UXS9 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CASP12Q6UXS9 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CASP12Q6UXS9 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CASP12Q6UXS9 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CASP12Q6UXS9 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CASP12Q6UXS9 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CASP12Q6UXS9 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CASP12Q6UXS9 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CASP12Q6UXS9 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CASP12Q6UXS9 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CASP12Q6UXS9 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CASP12Q6UXS9 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CASP12Q6UXS9 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CASP12Q6UXS9 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CASP12Q6UXS9 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CASP12Q6UXS9 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CASP12Q6UXS9 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CASP12Q6UXS9 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CASP12Q6UXS9 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CASP12Q6UXS9 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CASP12Q6UXS9 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CASP12Q6UXS9 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CASP12Q6UXS9 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CASP12Q6UXS9 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CASP12Q6UXS9 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CASP12Q6UXS9 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CASP12Q6UXS9 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms