Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SUSD1Q6UWL2 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SUSD1Q6UWL2 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SUSD1Q6UWL2 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SUSD1Q6UWL2 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SUSD1Q6UWL2 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SUSD1Q6UWL2 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SUSD1Q6UWL2 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SUSD1Q6UWL2 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SUSD1Q6UWL2 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SUSD1Q6UWL2 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SUSD1Q6UWL2 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SUSD1Q6UWL2 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SUSD1Q6UWL2 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SUSD1Q6UWL2 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SUSD1Q6UWL2 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SUSD1Q6UWL2 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SUSD1Q6UWL2 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SUSD1Q6UWL2 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SUSD1Q6UWL2 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SUSD1Q6UWL2 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SUSD1Q6UWL2 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SUSD1Q6UWL2 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SUSD1Q6UWL2 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SUSD1Q6UWL2 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SUSD1Q6UWL2 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SUSD1Q6UWL2 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SUSD1Q6UWL2 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SUSD1Q6UWL2 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SUSD1Q6UWL2 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SUSD1Q6UWL2 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SUSD1Q6UWL2 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SUSD1Q6UWL2 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SUSD1Q6UWL2 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SUSD1Q6UWL2 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SUSD1Q6UWL2 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SUSD1Q6UWL2 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SUSD1Q6UWL2 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SUSD1Q6UWL2 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SUSD1Q6UWL2 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SUSD1Q6UWL2 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SUSD1Q6UWL2 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SUSD1Q6UWL2 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SUSD1Q6UWL2 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SUSD1Q6UWL2 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SUSD1Q6UWL2 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SUSD1Q6UWL2 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SUSD1Q6UWL2 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SUSD1Q6UWL2 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SUSD1Q6UWL2 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SUSD1Q6UWL2 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SUSD1Q6UWL2 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SUSD1Q6UWL2 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SUSD1Q6UWL2 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SUSD1Q6UWL2 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SUSD1Q6UWL2 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SUSD1Q6UWL2 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SUSD1Q6UWL2 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SUSD1Q6UWL2 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SUSD1Q6UWL2 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SUSD1Q6UWL2 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SUSD1Q6UWL2 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SUSD1Q6UWL2 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SUSD1Q6UWL2 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SUSD1Q6UWL2 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SUSD1Q6UWL2 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SUSD1Q6UWL2 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SUSD1Q6UWL2 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SUSD1Q6UWL2 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SUSD1Q6UWL2 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SUSD1Q6UWL2 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SUSD1Q6UWL2 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SUSD1Q6UWL2 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SUSD1Q6UWL2 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SUSD1Q6UWL2 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SUSD1Q6UWL2 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SUSD1Q6UWL2 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SUSD1Q6UWL2 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SUSD1Q6UWL2 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SUSD1Q6UWL2 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SUSD1Q6UWL2 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SUSD1Q6UWL2 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SUSD1Q6UWL2 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SUSD1Q6UWL2 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SUSD1Q6UWL2 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SUSD1Q6UWL2 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SUSD1Q6UWL2 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SUSD1Q6UWL2 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SUSD1Q6UWL2 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SUSD1Q6UWL2 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SUSD1Q6UWL2 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SUSD1Q6UWL2 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SUSD1Q6UWL2 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SUSD1Q6UWL2 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SUSD1Q6UWL2 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SUSD1Q6UWL2 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SUSD1Q6UWL2 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SUSD1Q6UWL2 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SUSD1Q6UWL2 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SUSD1Q6UWL2 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms