Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW56

ATRAID, All-trans retinoic acid-induced differentiation factor, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRAIDQ6UW56 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATRAIDQ6UW56 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATRAIDQ6UW56 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATRAIDQ6UW56 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATRAIDQ6UW56 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATRAIDQ6UW56 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATRAIDQ6UW56 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATRAIDQ6UW56 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATRAIDQ6UW56 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATRAIDQ6UW56 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATRAIDQ6UW56 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATRAIDQ6UW56 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATRAIDQ6UW56 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATRAIDQ6UW56 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATRAIDQ6UW56 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATRAIDQ6UW56 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATRAIDQ6UW56 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATRAIDQ6UW56 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATRAIDQ6UW56 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ATRAIDQ6UW56 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATRAIDQ6UW56 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATRAIDQ6UW56 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATRAIDQ6UW56 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATRAIDQ6UW56 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATRAIDQ6UW56 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATRAIDQ6UW56 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATRAIDQ6UW56 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATRAIDQ6UW56 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATRAIDQ6UW56 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATRAIDQ6UW56 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATRAIDQ6UW56 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATRAIDQ6UW56 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATRAIDQ6UW56 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATRAIDQ6UW56 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATRAIDQ6UW56 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATRAIDQ6UW56 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATRAIDQ6UW56 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATRAIDQ6UW56 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATRAIDQ6UW56 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATRAIDQ6UW56 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATRAIDQ6UW56 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATRAIDQ6UW56 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATRAIDQ6UW56 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ATRAIDQ6UW56 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATRAIDQ6UW56 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATRAIDQ6UW56 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATRAIDQ6UW56 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATRAIDQ6UW56 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATRAIDQ6UW56 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATRAIDQ6UW56 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATRAIDQ6UW56 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATRAIDQ6UW56 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATRAIDQ6UW56 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATRAIDQ6UW56 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATRAIDQ6UW56 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATRAIDQ6UW56 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATRAIDQ6UW56 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATRAIDQ6UW56 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ATRAIDQ6UW56 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATRAIDQ6UW56 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATRAIDQ6UW56 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATRAIDQ6UW56 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATRAIDQ6UW56 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATRAIDQ6UW56 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATRAIDQ6UW56 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATRAIDQ6UW56 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATRAIDQ6UW56 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATRAIDQ6UW56 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATRAIDQ6UW56 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATRAIDQ6UW56 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATRAIDQ6UW56 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATRAIDQ6UW56 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATRAIDQ6UW56 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATRAIDQ6UW56 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATRAIDQ6UW56 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATRAIDQ6UW56 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATRAIDQ6UW56 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATRAIDQ6UW56 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATRAIDQ6UW56 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATRAIDQ6UW56 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATRAIDQ6UW56 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATRAIDQ6UW56 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATRAIDQ6UW56 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATRAIDQ6UW56 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATRAIDQ6UW56 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATRAIDQ6UW56 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATRAIDQ6UW56 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATRAIDQ6UW56 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATRAIDQ6UW56 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATRAIDQ6UW56 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATRAIDQ6UW56 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
ATRAIDQ6UW56 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
ATRAIDQ6UW56 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
ATRAIDQ6UW56 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
ATRAIDQ6UW56 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATRAIDQ6UW56 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATRAIDQ6UW56 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATRAIDQ6UW56 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATRAIDQ6UW56 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATRAIDQ6UW56 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms