Protein–RNA interactions for Protein: Q6UVM3

KCNT2, Potassium channel subfamily T member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT2Q6UVM3 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KCNT2Q6UVM3 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KCNT2Q6UVM3 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
KCNT2Q6UVM3 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KCNT2Q6UVM3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KCNT2Q6UVM3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KCNT2Q6UVM3 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KCNT2Q6UVM3 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KCNT2Q6UVM3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNT2Q6UVM3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNT2Q6UVM3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNT2Q6UVM3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNT2Q6UVM3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNT2Q6UVM3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNT2Q6UVM3 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNT2Q6UVM3 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNT2Q6UVM3 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNT2Q6UVM3 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNT2Q6UVM3 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNT2Q6UVM3 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNT2Q6UVM3 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNT2Q6UVM3 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNT2Q6UVM3 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNT2Q6UVM3 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNT2Q6UVM3 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNT2Q6UVM3 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNT2Q6UVM3 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNT2Q6UVM3 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNT2Q6UVM3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNT2Q6UVM3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNT2Q6UVM3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNT2Q6UVM3 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNT2Q6UVM3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNT2Q6UVM3 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNT2Q6UVM3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNT2Q6UVM3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNT2Q6UVM3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNT2Q6UVM3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNT2Q6UVM3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNT2Q6UVM3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNT2Q6UVM3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNT2Q6UVM3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNT2Q6UVM3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNT2Q6UVM3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNT2Q6UVM3 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNT2Q6UVM3 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNT2Q6UVM3 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNT2Q6UVM3 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNT2Q6UVM3 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNT2Q6UVM3 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNT2Q6UVM3 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNT2Q6UVM3 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNT2Q6UVM3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNT2Q6UVM3 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNT2Q6UVM3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNT2Q6UVM3 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNT2Q6UVM3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNT2Q6UVM3 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNT2Q6UVM3 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNT2Q6UVM3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNT2Q6UVM3 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNT2Q6UVM3 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNT2Q6UVM3 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNT2Q6UVM3 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNT2Q6UVM3 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNT2Q6UVM3 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNT2Q6UVM3 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNT2Q6UVM3 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNT2Q6UVM3 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNT2Q6UVM3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNT2Q6UVM3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNT2Q6UVM3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNT2Q6UVM3 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNT2Q6UVM3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNT2Q6UVM3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNT2Q6UVM3 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNT2Q6UVM3 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNT2Q6UVM3 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNT2Q6UVM3 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNT2Q6UVM3 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNT2Q6UVM3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNT2Q6UVM3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNT2Q6UVM3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNT2Q6UVM3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNT2Q6UVM3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNT2Q6UVM3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNT2Q6UVM3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNT2Q6UVM3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNT2Q6UVM3 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNT2Q6UVM3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNT2Q6UVM3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNT2Q6UVM3 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNT2Q6UVM3 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNT2Q6UVM3 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNT2Q6UVM3 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNT2Q6UVM3 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNT2Q6UVM3 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNT2Q6UVM3 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNT2Q6UVM3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNT2Q6UVM3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms