Protein–RNA interactions for Protein: Q6PJF5

RHBDF2, Inactive rhomboid protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDF2Q6PJF5 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
RHBDF2Q6PJF5 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RHBDF2Q6PJF5 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RHBDF2Q6PJF5 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RHBDF2Q6PJF5 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RHBDF2Q6PJF5 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RHBDF2Q6PJF5 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RHBDF2Q6PJF5 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RHBDF2Q6PJF5 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RHBDF2Q6PJF5 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RHBDF2Q6PJF5 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RHBDF2Q6PJF5 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHBDF2Q6PJF5 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHBDF2Q6PJF5 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHBDF2Q6PJF5 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHBDF2Q6PJF5 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHBDF2Q6PJF5 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHBDF2Q6PJF5 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHBDF2Q6PJF5 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHBDF2Q6PJF5 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHBDF2Q6PJF5 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHBDF2Q6PJF5 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RHBDF2Q6PJF5 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHBDF2Q6PJF5 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHBDF2Q6PJF5 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHBDF2Q6PJF5 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHBDF2Q6PJF5 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RHBDF2Q6PJF5 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHBDF2Q6PJF5 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHBDF2Q6PJF5 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHBDF2Q6PJF5 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHBDF2Q6PJF5 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHBDF2Q6PJF5 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHBDF2Q6PJF5 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHBDF2Q6PJF5 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHBDF2Q6PJF5 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHBDF2Q6PJF5 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHBDF2Q6PJF5 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHBDF2Q6PJF5 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHBDF2Q6PJF5 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHBDF2Q6PJF5 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHBDF2Q6PJF5 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHBDF2Q6PJF5 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHBDF2Q6PJF5 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHBDF2Q6PJF5 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RHBDF2Q6PJF5 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHBDF2Q6PJF5 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHBDF2Q6PJF5 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHBDF2Q6PJF5 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHBDF2Q6PJF5 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHBDF2Q6PJF5 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHBDF2Q6PJF5 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHBDF2Q6PJF5 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHBDF2Q6PJF5 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RHBDF2Q6PJF5 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RHBDF2Q6PJF5 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHBDF2Q6PJF5 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHBDF2Q6PJF5 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHBDF2Q6PJF5 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHBDF2Q6PJF5 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHBDF2Q6PJF5 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHBDF2Q6PJF5 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RHBDF2Q6PJF5 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHBDF2Q6PJF5 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RHBDF2Q6PJF5 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHBDF2Q6PJF5 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHBDF2Q6PJF5 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHBDF2Q6PJF5 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHBDF2Q6PJF5 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHBDF2Q6PJF5 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHBDF2Q6PJF5 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHBDF2Q6PJF5 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHBDF2Q6PJF5 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RHBDF2Q6PJF5 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHBDF2Q6PJF5 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHBDF2Q6PJF5 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHBDF2Q6PJF5 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHBDF2Q6PJF5 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHBDF2Q6PJF5 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHBDF2Q6PJF5 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHBDF2Q6PJF5 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHBDF2Q6PJF5 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHBDF2Q6PJF5 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHBDF2Q6PJF5 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHBDF2Q6PJF5 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHBDF2Q6PJF5 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHBDF2Q6PJF5 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHBDF2Q6PJF5 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHBDF2Q6PJF5 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHBDF2Q6PJF5 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHBDF2Q6PJF5 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHBDF2Q6PJF5 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHBDF2Q6PJF5 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHBDF2Q6PJF5 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHBDF2Q6PJF5 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHBDF2Q6PJF5 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHBDF2Q6PJF5 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHBDF2Q6PJF5 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHBDF2Q6PJF5 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RHBDF2Q6PJF5 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.6 ms