Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEW1

ZCCHC12, Zinc finger CCHC domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC12Q6PEW1 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZCCHC12Q6PEW1 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZCCHC12Q6PEW1 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZCCHC12Q6PEW1 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZCCHC12Q6PEW1 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZCCHC12Q6PEW1 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZCCHC12Q6PEW1 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZCCHC12Q6PEW1 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ZCCHC12Q6PEW1 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZCCHC12Q6PEW1 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZCCHC12Q6PEW1 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZCCHC12Q6PEW1 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZCCHC12Q6PEW1 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ZCCHC12Q6PEW1 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZCCHC12Q6PEW1 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZCCHC12Q6PEW1 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZCCHC12Q6PEW1 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZCCHC12Q6PEW1 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZCCHC12Q6PEW1 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZCCHC12Q6PEW1 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZCCHC12Q6PEW1 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ZCCHC12Q6PEW1 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ZCCHC12Q6PEW1 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZCCHC12Q6PEW1 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZCCHC12Q6PEW1 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZCCHC12Q6PEW1 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZCCHC12Q6PEW1 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZCCHC12Q6PEW1 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ZCCHC12Q6PEW1 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZCCHC12Q6PEW1 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZCCHC12Q6PEW1 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZCCHC12Q6PEW1 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZCCHC12Q6PEW1 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZCCHC12Q6PEW1 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ZCCHC12Q6PEW1 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZCCHC12Q6PEW1 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZCCHC12Q6PEW1 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ZCCHC12Q6PEW1 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZCCHC12Q6PEW1 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZCCHC12Q6PEW1 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZCCHC12Q6PEW1 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZCCHC12Q6PEW1 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZCCHC12Q6PEW1 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZCCHC12Q6PEW1 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZCCHC12Q6PEW1 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZCCHC12Q6PEW1 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZCCHC12Q6PEW1 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZCCHC12Q6PEW1 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ZCCHC12Q6PEW1 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZCCHC12Q6PEW1 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZCCHC12Q6PEW1 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZCCHC12Q6PEW1 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZCCHC12Q6PEW1 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZCCHC12Q6PEW1 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZCCHC12Q6PEW1 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZCCHC12Q6PEW1 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZCCHC12Q6PEW1 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZCCHC12Q6PEW1 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZCCHC12Q6PEW1 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZCCHC12Q6PEW1 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZCCHC12Q6PEW1 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZCCHC12Q6PEW1 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZCCHC12Q6PEW1 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZCCHC12Q6PEW1 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZCCHC12Q6PEW1 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZCCHC12Q6PEW1 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ZCCHC12Q6PEW1 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZCCHC12Q6PEW1 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZCCHC12Q6PEW1 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZCCHC12Q6PEW1 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZCCHC12Q6PEW1 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZCCHC12Q6PEW1 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZCCHC12Q6PEW1 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZCCHC12Q6PEW1 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZCCHC12Q6PEW1 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ZCCHC12Q6PEW1 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZCCHC12Q6PEW1 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZCCHC12Q6PEW1 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZCCHC12Q6PEW1 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZCCHC12Q6PEW1 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZCCHC12Q6PEW1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZCCHC12Q6PEW1 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZCCHC12Q6PEW1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZCCHC12Q6PEW1 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZCCHC12Q6PEW1 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZCCHC12Q6PEW1 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZCCHC12Q6PEW1 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZCCHC12Q6PEW1 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZCCHC12Q6PEW1 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZCCHC12Q6PEW1 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZCCHC12Q6PEW1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZCCHC12Q6PEW1 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZCCHC12Q6PEW1 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZCCHC12Q6PEW1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZCCHC12Q6PEW1 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZCCHC12Q6PEW1 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZCCHC12Q6PEW1 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZCCHC12Q6PEW1 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZCCHC12Q6PEW1 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZCCHC12Q6PEW1 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms