Protein–RNA interactions for Protein: Q6NY19

KANK3, KN motif and ankyrin repeat domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KANK3Q6NY19 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KANK3Q6NY19 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KANK3Q6NY19 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KANK3Q6NY19 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KANK3Q6NY19 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
KANK3Q6NY19 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
KANK3Q6NY19 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
KANK3Q6NY19 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KANK3Q6NY19 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KANK3Q6NY19 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KANK3Q6NY19 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KANK3Q6NY19 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KANK3Q6NY19 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KANK3Q6NY19 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KANK3Q6NY19 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KANK3Q6NY19 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KANK3Q6NY19 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KANK3Q6NY19 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KANK3Q6NY19 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KANK3Q6NY19 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KANK3Q6NY19 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KANK3Q6NY19 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KANK3Q6NY19 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KANK3Q6NY19 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KANK3Q6NY19 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KANK3Q6NY19 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KANK3Q6NY19 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KANK3Q6NY19 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KANK3Q6NY19 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KANK3Q6NY19 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KANK3Q6NY19 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KANK3Q6NY19 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KANK3Q6NY19 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KANK3Q6NY19 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KANK3Q6NY19 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KANK3Q6NY19 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KANK3Q6NY19 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KANK3Q6NY19 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KANK3Q6NY19 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KANK3Q6NY19 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KANK3Q6NY19 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KANK3Q6NY19 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KANK3Q6NY19 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KANK3Q6NY19 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KANK3Q6NY19 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KANK3Q6NY19 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KANK3Q6NY19 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KANK3Q6NY19 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KANK3Q6NY19 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KANK3Q6NY19 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KANK3Q6NY19 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KANK3Q6NY19 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KANK3Q6NY19 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KANK3Q6NY19 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KANK3Q6NY19 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KANK3Q6NY19 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KANK3Q6NY19 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KANK3Q6NY19 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KANK3Q6NY19 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KANK3Q6NY19 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
KANK3Q6NY19 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KANK3Q6NY19 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
KANK3Q6NY19 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KANK3Q6NY19 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KANK3Q6NY19 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KANK3Q6NY19 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KANK3Q6NY19 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KANK3Q6NY19 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KANK3Q6NY19 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KANK3Q6NY19 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KANK3Q6NY19 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KANK3Q6NY19 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KANK3Q6NY19 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KANK3Q6NY19 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KANK3Q6NY19 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
KANK3Q6NY19 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KANK3Q6NY19 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KANK3Q6NY19 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KANK3Q6NY19 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KANK3Q6NY19 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KANK3Q6NY19 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KANK3Q6NY19 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
KANK3Q6NY19 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KANK3Q6NY19 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KANK3Q6NY19 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KANK3Q6NY19 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KANK3Q6NY19 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KANK3Q6NY19 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KANK3Q6NY19 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KANK3Q6NY19 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KANK3Q6NY19 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KANK3Q6NY19 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
KANK3Q6NY19 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
KANK3Q6NY19 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
KANK3Q6NY19 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KANK3Q6NY19 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KANK3Q6NY19 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KANK3Q6NY19 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KANK3Q6NY19 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KANK3Q6NY19 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms