Protein–RNA interactions for Protein: Q6NX49

ZNF544, Zinc finger protein 544, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF544Q6NX49 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF544Q6NX49 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF544Q6NX49 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF544Q6NX49 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF544Q6NX49 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF544Q6NX49 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF544Q6NX49 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF544Q6NX49 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF544Q6NX49 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF544Q6NX49 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF544Q6NX49 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF544Q6NX49 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF544Q6NX49 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF544Q6NX49 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF544Q6NX49 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF544Q6NX49 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF544Q6NX49 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF544Q6NX49 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF544Q6NX49 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF544Q6NX49 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF544Q6NX49 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF544Q6NX49 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF544Q6NX49 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF544Q6NX49 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF544Q6NX49 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF544Q6NX49 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF544Q6NX49 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF544Q6NX49 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF544Q6NX49 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF544Q6NX49 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF544Q6NX49 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF544Q6NX49 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF544Q6NX49 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF544Q6NX49 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF544Q6NX49 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF544Q6NX49 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF544Q6NX49 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF544Q6NX49 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF544Q6NX49 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF544Q6NX49 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF544Q6NX49 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF544Q6NX49 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF544Q6NX49 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF544Q6NX49 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF544Q6NX49 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF544Q6NX49 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF544Q6NX49 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF544Q6NX49 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF544Q6NX49 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF544Q6NX49 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF544Q6NX49 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF544Q6NX49 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF544Q6NX49 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF544Q6NX49 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF544Q6NX49 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF544Q6NX49 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF544Q6NX49 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF544Q6NX49 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF544Q6NX49 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF544Q6NX49 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF544Q6NX49 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF544Q6NX49 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF544Q6NX49 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF544Q6NX49 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF544Q6NX49 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF544Q6NX49 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF544Q6NX49 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF544Q6NX49 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF544Q6NX49 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF544Q6NX49 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF544Q6NX49 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF544Q6NX49 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF544Q6NX49 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF544Q6NX49 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZNF544Q6NX49 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZNF544Q6NX49 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZNF544Q6NX49 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZNF544Q6NX49 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZNF544Q6NX49 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF544Q6NX49 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF544Q6NX49 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF544Q6NX49 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF544Q6NX49 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF544Q6NX49 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF544Q6NX49 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF544Q6NX49 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF544Q6NX49 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF544Q6NX49 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF544Q6NX49 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF544Q6NX49 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF544Q6NX49 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF544Q6NX49 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF544Q6NX49 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF544Q6NX49 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF544Q6NX49 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF544Q6NX49 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF544Q6NX49 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF544Q6NX49 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF544Q6NX49 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF544Q6NX49 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms