Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW34

NEPRO, Nucleolus and neural progenitor protein, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEPROQ6NW34 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NEPROQ6NW34 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NEPROQ6NW34 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NEPROQ6NW34 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
NEPROQ6NW34 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NEPROQ6NW34 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NEPROQ6NW34 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
NEPROQ6NW34 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NEPROQ6NW34 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
NEPROQ6NW34 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NEPROQ6NW34 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NEPROQ6NW34 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NEPROQ6NW34 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NEPROQ6NW34 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NEPROQ6NW34 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NEPROQ6NW34 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NEPROQ6NW34 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NEPROQ6NW34 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NEPROQ6NW34 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
NEPROQ6NW34 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.95
NEPROQ6NW34 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NEPROQ6NW34 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NEPROQ6NW34 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NEPROQ6NW34 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NEPROQ6NW34 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NEPROQ6NW34 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NEPROQ6NW34 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NEPROQ6NW34 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NEPROQ6NW34 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NEPROQ6NW34 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NEPROQ6NW34 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NEPROQ6NW34 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NEPROQ6NW34 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NEPROQ6NW34 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NEPROQ6NW34 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NEPROQ6NW34 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NEPROQ6NW34 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NEPROQ6NW34 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NEPROQ6NW34 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NEPROQ6NW34 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NEPROQ6NW34 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NEPROQ6NW34 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NEPROQ6NW34 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NEPROQ6NW34 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NEPROQ6NW34 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NEPROQ6NW34 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NEPROQ6NW34 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NEPROQ6NW34 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NEPROQ6NW34 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NEPROQ6NW34 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NEPROQ6NW34 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NEPROQ6NW34 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NEPROQ6NW34 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NEPROQ6NW34 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NEPROQ6NW34 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NEPROQ6NW34 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NEPROQ6NW34 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NEPROQ6NW34 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NEPROQ6NW34 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NEPROQ6NW34 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NEPROQ6NW34 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NEPROQ6NW34 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NEPROQ6NW34 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NEPROQ6NW34 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NEPROQ6NW34 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NEPROQ6NW34 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NEPROQ6NW34 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NEPROQ6NW34 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NEPROQ6NW34 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NEPROQ6NW34 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NEPROQ6NW34 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
NEPROQ6NW34 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NEPROQ6NW34 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NEPROQ6NW34 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NEPROQ6NW34 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NEPROQ6NW34 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NEPROQ6NW34 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NEPROQ6NW34 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NEPROQ6NW34 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NEPROQ6NW34 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NEPROQ6NW34 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NEPROQ6NW34 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NEPROQ6NW34 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NEPROQ6NW34 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NEPROQ6NW34 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NEPROQ6NW34 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NEPROQ6NW34 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NEPROQ6NW34 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NEPROQ6NW34 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
NEPROQ6NW34 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NEPROQ6NW34 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
NEPROQ6NW34 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NEPROQ6NW34 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NEPROQ6NW34 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NEPROQ6NW34 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NEPROQ6NW34 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NEPROQ6NW34 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NEPROQ6NW34 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NEPROQ6NW34 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NEPROQ6NW34 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms