Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVH7

SWSAP1, ATPase SWSAP1, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWSAP1Q6NVH7 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SWSAP1Q6NVH7 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SWSAP1Q6NVH7 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SWSAP1Q6NVH7 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SWSAP1Q6NVH7 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SWSAP1Q6NVH7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SWSAP1Q6NVH7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SWSAP1Q6NVH7 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SWSAP1Q6NVH7 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SWSAP1Q6NVH7 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SWSAP1Q6NVH7 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SWSAP1Q6NVH7 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SWSAP1Q6NVH7 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SWSAP1Q6NVH7 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SWSAP1Q6NVH7 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SWSAP1Q6NVH7 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SWSAP1Q6NVH7 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SWSAP1Q6NVH7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SWSAP1Q6NVH7 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SWSAP1Q6NVH7 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SWSAP1Q6NVH7 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SWSAP1Q6NVH7 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SWSAP1Q6NVH7 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SWSAP1Q6NVH7 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SWSAP1Q6NVH7 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SWSAP1Q6NVH7 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SWSAP1Q6NVH7 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SWSAP1Q6NVH7 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SWSAP1Q6NVH7 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SWSAP1Q6NVH7 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SWSAP1Q6NVH7 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SWSAP1Q6NVH7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SWSAP1Q6NVH7 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SWSAP1Q6NVH7 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SWSAP1Q6NVH7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SWSAP1Q6NVH7 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SWSAP1Q6NVH7 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SWSAP1Q6NVH7 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SWSAP1Q6NVH7 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SWSAP1Q6NVH7 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SWSAP1Q6NVH7 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SWSAP1Q6NVH7 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SWSAP1Q6NVH7 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SWSAP1Q6NVH7 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SWSAP1Q6NVH7 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SWSAP1Q6NVH7 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SWSAP1Q6NVH7 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SWSAP1Q6NVH7 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SWSAP1Q6NVH7 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SWSAP1Q6NVH7 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SWSAP1Q6NVH7 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SWSAP1Q6NVH7 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SWSAP1Q6NVH7 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SWSAP1Q6NVH7 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SWSAP1Q6NVH7 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SWSAP1Q6NVH7 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SWSAP1Q6NVH7 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SWSAP1Q6NVH7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SWSAP1Q6NVH7 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SWSAP1Q6NVH7 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SWSAP1Q6NVH7 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SWSAP1Q6NVH7 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SWSAP1Q6NVH7 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SWSAP1Q6NVH7 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SWSAP1Q6NVH7 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SWSAP1Q6NVH7 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SWSAP1Q6NVH7 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SWSAP1Q6NVH7 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SWSAP1Q6NVH7 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SWSAP1Q6NVH7 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SWSAP1Q6NVH7 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SWSAP1Q6NVH7 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SWSAP1Q6NVH7 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SWSAP1Q6NVH7 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SWSAP1Q6NVH7 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SWSAP1Q6NVH7 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SWSAP1Q6NVH7 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SWSAP1Q6NVH7 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SWSAP1Q6NVH7 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SWSAP1Q6NVH7 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SWSAP1Q6NVH7 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SWSAP1Q6NVH7 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SWSAP1Q6NVH7 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SWSAP1Q6NVH7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SWSAP1Q6NVH7 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SWSAP1Q6NVH7 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SWSAP1Q6NVH7 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SWSAP1Q6NVH7 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SWSAP1Q6NVH7 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SWSAP1Q6NVH7 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SWSAP1Q6NVH7 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SWSAP1Q6NVH7 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SWSAP1Q6NVH7 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SWSAP1Q6NVH7 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SWSAP1Q6NVH7 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SWSAP1Q6NVH7 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SWSAP1Q6NVH7 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SWSAP1Q6NVH7 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SWSAP1Q6NVH7 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SWSAP1Q6NVH7 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms