Protein–RNA interactions for Protein: Q6DKI2

LGALS9C, Galectin-9C, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGALS9CQ6DKI2 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LGALS9CQ6DKI2 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LGALS9CQ6DKI2 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LGALS9CQ6DKI2 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LGALS9CQ6DKI2 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms