Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ANKRD40Q6AI12 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ANKRD40Q6AI12 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ANKRD40Q6AI12 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ANKRD40Q6AI12 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ANKRD40Q6AI12 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ANKRD40Q6AI12 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ANKRD40Q6AI12 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ANKRD40Q6AI12 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ANKRD40Q6AI12 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ANKRD40Q6AI12 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ANKRD40Q6AI12 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ANKRD40Q6AI12 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ANKRD40Q6AI12 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ANKRD40Q6AI12 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ANKRD40Q6AI12 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ANKRD40Q6AI12 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ANKRD40Q6AI12 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ANKRD40Q6AI12 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ANKRD40Q6AI12 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ANKRD40Q6AI12 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ANKRD40Q6AI12 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ANKRD40Q6AI12 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ANKRD40Q6AI12 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ANKRD40Q6AI12 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ANKRD40Q6AI12 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ANKRD40Q6AI12 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ANKRD40Q6AI12 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ANKRD40Q6AI12 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ANKRD40Q6AI12 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ANKRD40Q6AI12 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ANKRD40Q6AI12 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ANKRD40Q6AI12 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ANKRD40Q6AI12 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ANKRD40Q6AI12 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ANKRD40Q6AI12 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ANKRD40Q6AI12 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ANKRD40Q6AI12 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ANKRD40Q6AI12 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ANKRD40Q6AI12 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ANKRD40Q6AI12 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ANKRD40Q6AI12 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ANKRD40Q6AI12 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ANKRD40Q6AI12 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ANKRD40Q6AI12 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ANKRD40Q6AI12 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ANKRD40Q6AI12 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ANKRD40Q6AI12 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ANKRD40Q6AI12 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ANKRD40Q6AI12 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ANKRD40Q6AI12 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ANKRD40Q6AI12 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ANKRD40Q6AI12 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ANKRD40Q6AI12 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ANKRD40Q6AI12 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ANKRD40Q6AI12 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ANKRD40Q6AI12 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ANKRD40Q6AI12 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ANKRD40Q6AI12 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ANKRD40Q6AI12 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ANKRD40Q6AI12 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ANKRD40Q6AI12 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
ANKRD40Q6AI12 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ANKRD40Q6AI12 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ANKRD40Q6AI12 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ANKRD40Q6AI12 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ANKRD40Q6AI12 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ANKRD40Q6AI12 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ANKRD40Q6AI12 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ANKRD40Q6AI12 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ANKRD40Q6AI12 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ANKRD40Q6AI12 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ANKRD40Q6AI12 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ANKRD40Q6AI12 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ANKRD40Q6AI12 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ANKRD40Q6AI12 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ANKRD40Q6AI12 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ANKRD40Q6AI12 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ANKRD40Q6AI12 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ANKRD40Q6AI12 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ANKRD40Q6AI12 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ANKRD40Q6AI12 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ANKRD40Q6AI12 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ANKRD40Q6AI12 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ANKRD40Q6AI12 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ANKRD40Q6AI12 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ANKRD40Q6AI12 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ANKRD40Q6AI12 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ANKRD40Q6AI12 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ANKRD40Q6AI12 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ANKRD40Q6AI12 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ANKRD40Q6AI12 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ANKRD40Q6AI12 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ANKRD40Q6AI12 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ANKRD40Q6AI12 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ANKRD40Q6AI12 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ANKRD40Q6AI12 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ANKRD40Q6AI12 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ANKRD40Q6AI12 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ANKRD40Q6AI12 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms