Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW22

AGAP6, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP6Q5VW22 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
AGAP6Q5VW22 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
AGAP6Q5VW22 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
AGAP6Q5VW22 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
AGAP6Q5VW22 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
AGAP6Q5VW22 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
AGAP6Q5VW22 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
AGAP6Q5VW22 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
AGAP6Q5VW22 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
AGAP6Q5VW22 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
AGAP6Q5VW22 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
AGAP6Q5VW22 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
AGAP6Q5VW22 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
AGAP6Q5VW22 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
AGAP6Q5VW22 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
AGAP6Q5VW22 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
AGAP6Q5VW22 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
AGAP6Q5VW22 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
AGAP6Q5VW22 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
AGAP6Q5VW22 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
AGAP6Q5VW22 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
AGAP6Q5VW22 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
AGAP6Q5VW22 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
AGAP6Q5VW22 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
AGAP6Q5VW22 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
AGAP6Q5VW22 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
AGAP6Q5VW22 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
AGAP6Q5VW22 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
AGAP6Q5VW22 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
AGAP6Q5VW22 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
AGAP6Q5VW22 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
AGAP6Q5VW22 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
AGAP6Q5VW22 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
AGAP6Q5VW22 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
AGAP6Q5VW22 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
AGAP6Q5VW22 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
AGAP6Q5VW22 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
AGAP6Q5VW22 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
AGAP6Q5VW22 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
AGAP6Q5VW22 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
AGAP6Q5VW22 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
AGAP6Q5VW22 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
AGAP6Q5VW22 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
AGAP6Q5VW22 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
AGAP6Q5VW22 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
AGAP6Q5VW22 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
AGAP6Q5VW22 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
AGAP6Q5VW22 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
AGAP6Q5VW22 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
AGAP6Q5VW22 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
AGAP6Q5VW22 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
AGAP6Q5VW22 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
AGAP6Q5VW22 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
AGAP6Q5VW22 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
AGAP6Q5VW22 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
AGAP6Q5VW22 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
AGAP6Q5VW22 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
AGAP6Q5VW22 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
AGAP6Q5VW22 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
AGAP6Q5VW22 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
AGAP6Q5VW22 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
AGAP6Q5VW22 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
AGAP6Q5VW22 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
AGAP6Q5VW22 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
AGAP6Q5VW22 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
AGAP6Q5VW22 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
AGAP6Q5VW22 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
AGAP6Q5VW22 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
AGAP6Q5VW22 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
AGAP6Q5VW22 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
AGAP6Q5VW22 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
AGAP6Q5VW22 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
AGAP6Q5VW22 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
AGAP6Q5VW22 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
AGAP6Q5VW22 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
AGAP6Q5VW22 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
AGAP6Q5VW22 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
AGAP6Q5VW22 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
AGAP6Q5VW22 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
AGAP6Q5VW22 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
AGAP6Q5VW22 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
AGAP6Q5VW22 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
AGAP6Q5VW22 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
AGAP6Q5VW22 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
AGAP6Q5VW22 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
AGAP6Q5VW22 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
AGAP6Q5VW22 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
AGAP6Q5VW22 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
AGAP6Q5VW22 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
AGAP6Q5VW22 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
AGAP6Q5VW22 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
AGAP6Q5VW22 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
AGAP6Q5VW22 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
AGAP6Q5VW22 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
AGAP6Q5VW22 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
AGAP6Q5VW22 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
AGAP6Q5VW22 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
AGAP6Q5VW22 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
AGAP6Q5VW22 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
AGAP6Q5VW22 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms