Protein–RNA interactions for Protein: Q5TAH2

SLC9C2, Sodium/hydrogen exchanger 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9C2Q5TAH2 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC9C2Q5TAH2 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC9C2Q5TAH2 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC9C2Q5TAH2 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC9C2Q5TAH2 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC9C2Q5TAH2 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC9C2Q5TAH2 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC9C2Q5TAH2 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC9C2Q5TAH2 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC9C2Q5TAH2 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC9C2Q5TAH2 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC9C2Q5TAH2 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC9C2Q5TAH2 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC9C2Q5TAH2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC9C2Q5TAH2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC9C2Q5TAH2 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC9C2Q5TAH2 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC9C2Q5TAH2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC9C2Q5TAH2 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC9C2Q5TAH2 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC9C2Q5TAH2 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC9C2Q5TAH2 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC9C2Q5TAH2 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC9C2Q5TAH2 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC9C2Q5TAH2 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC9C2Q5TAH2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC9C2Q5TAH2 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC9C2Q5TAH2 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC9C2Q5TAH2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC9C2Q5TAH2 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC9C2Q5TAH2 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC9C2Q5TAH2 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC9C2Q5TAH2 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC9C2Q5TAH2 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC9C2Q5TAH2 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC9C2Q5TAH2 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC9C2Q5TAH2 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC9C2Q5TAH2 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC9C2Q5TAH2 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC9C2Q5TAH2 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC9C2Q5TAH2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC9C2Q5TAH2 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC9C2Q5TAH2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC9C2Q5TAH2 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC9C2Q5TAH2 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC9C2Q5TAH2 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC9C2Q5TAH2 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC9C2Q5TAH2 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC9C2Q5TAH2 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC9C2Q5TAH2 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC9C2Q5TAH2 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC9C2Q5TAH2 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC9C2Q5TAH2 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC9C2Q5TAH2 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC9C2Q5TAH2 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC9C2Q5TAH2 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC9C2Q5TAH2 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC9C2Q5TAH2 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC9C2Q5TAH2 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC9C2Q5TAH2 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC9C2Q5TAH2 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC9C2Q5TAH2 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC9C2Q5TAH2 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC9C2Q5TAH2 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC9C2Q5TAH2 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC9C2Q5TAH2 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC9C2Q5TAH2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC9C2Q5TAH2 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC9C2Q5TAH2 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC9C2Q5TAH2 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC9C2Q5TAH2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC9C2Q5TAH2 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC9C2Q5TAH2 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC9C2Q5TAH2 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC9C2Q5TAH2 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC9C2Q5TAH2 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC9C2Q5TAH2 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC9C2Q5TAH2 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC9C2Q5TAH2 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC9C2Q5TAH2 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC9C2Q5TAH2 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC9C2Q5TAH2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC9C2Q5TAH2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC9C2Q5TAH2 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC9C2Q5TAH2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC9C2Q5TAH2 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC9C2Q5TAH2 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC9C2Q5TAH2 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC9C2Q5TAH2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC9C2Q5TAH2 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC9C2Q5TAH2 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC9C2Q5TAH2 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC9C2Q5TAH2 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC9C2Q5TAH2 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC9C2Q5TAH2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC9C2Q5TAH2 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC9C2Q5TAH2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC9C2Q5TAH2 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC9C2Q5TAH2 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC9C2Q5TAH2 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms