Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SFT2D3Q587I9 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SFT2D3Q587I9 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SFT2D3Q587I9 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SFT2D3Q587I9 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SFT2D3Q587I9 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SFT2D3Q587I9 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SFT2D3Q587I9 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SFT2D3Q587I9 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SFT2D3Q587I9 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SFT2D3Q587I9 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SFT2D3Q587I9 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SFT2D3Q587I9 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SFT2D3Q587I9 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SFT2D3Q587I9 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SFT2D3Q587I9 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SFT2D3Q587I9 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SFT2D3Q587I9 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SFT2D3Q587I9 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SFT2D3Q587I9 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SFT2D3Q587I9 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SFT2D3Q587I9 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SFT2D3Q587I9 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SFT2D3Q587I9 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SFT2D3Q587I9 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SFT2D3Q587I9 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SFT2D3Q587I9 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SFT2D3Q587I9 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SFT2D3Q587I9 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SFT2D3Q587I9 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SFT2D3Q587I9 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SFT2D3Q587I9 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SFT2D3Q587I9 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SFT2D3Q587I9 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SFT2D3Q587I9 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SFT2D3Q587I9 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SFT2D3Q587I9 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SFT2D3Q587I9 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SFT2D3Q587I9 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SFT2D3Q587I9 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SFT2D3Q587I9 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SFT2D3Q587I9 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
SFT2D3Q587I9 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SFT2D3Q587I9 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SFT2D3Q587I9 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SFT2D3Q587I9 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SFT2D3Q587I9 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SFT2D3Q587I9 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SFT2D3Q587I9 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SFT2D3Q587I9 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SFT2D3Q587I9 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SFT2D3Q587I9 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SFT2D3Q587I9 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SFT2D3Q587I9 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SFT2D3Q587I9 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SFT2D3Q587I9 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SFT2D3Q587I9 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SFT2D3Q587I9 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SFT2D3Q587I9 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SFT2D3Q587I9 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SFT2D3Q587I9 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SFT2D3Q587I9 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SFT2D3Q587I9 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SFT2D3Q587I9 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SFT2D3Q587I9 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SFT2D3Q587I9 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SFT2D3Q587I9 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SFT2D3Q587I9 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SFT2D3Q587I9 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SFT2D3Q587I9 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SFT2D3Q587I9 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SFT2D3Q587I9 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SFT2D3Q587I9 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SFT2D3Q587I9 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SFT2D3Q587I9 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SFT2D3Q587I9 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SFT2D3Q587I9 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SFT2D3Q587I9 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SFT2D3Q587I9 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SFT2D3Q587I9 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SFT2D3Q587I9 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SFT2D3Q587I9 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SFT2D3Q587I9 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SFT2D3Q587I9 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SFT2D3Q587I9 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SFT2D3Q587I9 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SFT2D3Q587I9 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SFT2D3Q587I9 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SFT2D3Q587I9 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SFT2D3Q587I9 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SFT2D3Q587I9 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SFT2D3Q587I9 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SFT2D3Q587I9 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SFT2D3Q587I9 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SFT2D3Q587I9 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SFT2D3Q587I9 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SFT2D3Q587I9 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SFT2D3Q587I9 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SFT2D3Q587I9 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SFT2D3Q587I9 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms