Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALFQ53S48 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALFQ53S48 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALFQ53S48 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALFQ53S48 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALFQ53S48 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALFQ53S48 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALFQ53S48 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALFQ53S48 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALFQ53S48 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ALFQ53S48 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ALFQ53S48 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ALFQ53S48 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ALFQ53S48 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ALFQ53S48 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ALFQ53S48 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ALFQ53S48 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ALFQ53S48 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ALFQ53S48 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ALFQ53S48 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ALFQ53S48 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ALFQ53S48 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ALFQ53S48 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALFQ53S48 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALFQ53S48 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALFQ53S48 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALFQ53S48 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALFQ53S48 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALFQ53S48 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALFQ53S48 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALFQ53S48 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALFQ53S48 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALFQ53S48 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALFQ53S48 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALFQ53S48 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALFQ53S48 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALFQ53S48 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALFQ53S48 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALFQ53S48 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALFQ53S48 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALFQ53S48 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALFQ53S48 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ALFQ53S48 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALFQ53S48 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALFQ53S48 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ALFQ53S48 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ALFQ53S48 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ALFQ53S48 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ALFQ53S48 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ALFQ53S48 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ALFQ53S48 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ALFQ53S48 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ALFQ53S48 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ALFQ53S48 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ALFQ53S48 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ALFQ53S48 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ALFQ53S48 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ALFQ53S48 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ALFQ53S48 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALFQ53S48 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALFQ53S48 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALFQ53S48 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ALFQ53S48 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ALFQ53S48 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALFQ53S48 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALFQ53S48 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALFQ53S48 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALFQ53S48 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALFQ53S48 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ALFQ53S48 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALFQ53S48 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALFQ53S48 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALFQ53S48 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ALFQ53S48 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALFQ53S48 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALFQ53S48 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALFQ53S48 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALFQ53S48 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALFQ53S48 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ALFQ53S48 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ALFQ53S48 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ALFQ53S48 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ALFQ53S48 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ALFQ53S48 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ALFQ53S48 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ALFQ53S48 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ALFQ53S48 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ALFQ53S48 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ALFQ53S48 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ALFQ53S48 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ALFQ53S48 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ALFQ53S48 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ALFQ53S48 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ALFQ53S48 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ALFQ53S48 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ALFQ53S48 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ALFQ53S48 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ALFQ53S48 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ALFQ53S48 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ALFQ53S48 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms