Protein–RNA interactions for Protein: Q53S33

BOLA3, BolA-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA3Q53S33 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BOLA3Q53S33 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BOLA3Q53S33 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BOLA3Q53S33 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BOLA3Q53S33 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BOLA3Q53S33 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BOLA3Q53S33 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BOLA3Q53S33 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BOLA3Q53S33 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BOLA3Q53S33 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BOLA3Q53S33 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
BOLA3Q53S33 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BOLA3Q53S33 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BOLA3Q53S33 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BOLA3Q53S33 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BOLA3Q53S33 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BOLA3Q53S33 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BOLA3Q53S33 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BOLA3Q53S33 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BOLA3Q53S33 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BOLA3Q53S33 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BOLA3Q53S33 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BOLA3Q53S33 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BOLA3Q53S33 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BOLA3Q53S33 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
BOLA3Q53S33 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BOLA3Q53S33 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BOLA3Q53S33 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BOLA3Q53S33 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BOLA3Q53S33 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BOLA3Q53S33 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BOLA3Q53S33 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BOLA3Q53S33 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BOLA3Q53S33 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BOLA3Q53S33 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BOLA3Q53S33 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BOLA3Q53S33 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BOLA3Q53S33 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BOLA3Q53S33 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BOLA3Q53S33 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BOLA3Q53S33 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BOLA3Q53S33 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BOLA3Q53S33 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BOLA3Q53S33 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BOLA3Q53S33 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BOLA3Q53S33 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BOLA3Q53S33 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BOLA3Q53S33 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
BOLA3Q53S33 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BOLA3Q53S33 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BOLA3Q53S33 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BOLA3Q53S33 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BOLA3Q53S33 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BOLA3Q53S33 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BOLA3Q53S33 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BOLA3Q53S33 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BOLA3Q53S33 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BOLA3Q53S33 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BOLA3Q53S33 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BOLA3Q53S33 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BOLA3Q53S33 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BOLA3Q53S33 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BOLA3Q53S33 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BOLA3Q53S33 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BOLA3Q53S33 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
BOLA3Q53S33 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BOLA3Q53S33 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BOLA3Q53S33 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BOLA3Q53S33 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BOLA3Q53S33 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BOLA3Q53S33 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BOLA3Q53S33 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BOLA3Q53S33 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BOLA3Q53S33 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BOLA3Q53S33 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BOLA3Q53S33 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BOLA3Q53S33 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BOLA3Q53S33 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BOLA3Q53S33 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BOLA3Q53S33 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BOLA3Q53S33 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BOLA3Q53S33 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BOLA3Q53S33 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BOLA3Q53S33 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BOLA3Q53S33 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
BOLA3Q53S33 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
BOLA3Q53S33 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BOLA3Q53S33 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
BOLA3Q53S33 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
BOLA3Q53S33 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
BOLA3Q53S33 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
BOLA3Q53S33 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
BOLA3Q53S33 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
BOLA3Q53S33 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BOLA3Q53S33 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BOLA3Q53S33 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BOLA3Q53S33 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BOLA3Q53S33 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BOLA3Q53S33 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BOLA3Q53S33 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms