Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL22Q53GT1 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL22Q53GT1 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL22Q53GT1 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL22Q53GT1 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL22Q53GT1 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL22Q53GT1 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL22Q53GT1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL22Q53GT1 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL22Q53GT1 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL22Q53GT1 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL22Q53GT1 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL22Q53GT1 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL22Q53GT1 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL22Q53GT1 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL22Q53GT1 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL22Q53GT1 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL22Q53GT1 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL22Q53GT1 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL22Q53GT1 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL22Q53GT1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL22Q53GT1 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL22Q53GT1 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL22Q53GT1 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL22Q53GT1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL22Q53GT1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL22Q53GT1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL22Q53GT1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL22Q53GT1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL22Q53GT1 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL22Q53GT1 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL22Q53GT1 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL22Q53GT1 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL22Q53GT1 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL22Q53GT1 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL22Q53GT1 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL22Q53GT1 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL22Q53GT1 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL22Q53GT1 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL22Q53GT1 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL22Q53GT1 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL22Q53GT1 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL22Q53GT1 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL22Q53GT1 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL22Q53GT1 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL22Q53GT1 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL22Q53GT1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL22Q53GT1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL22Q53GT1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL22Q53GT1 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL22Q53GT1 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL22Q53GT1 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL22Q53GT1 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL22Q53GT1 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL22Q53GT1 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL22Q53GT1 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
KLHL22Q53GT1 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
KLHL22Q53GT1 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
KLHL22Q53GT1 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
KLHL22Q53GT1 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
KLHL22Q53GT1 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
KLHL22Q53GT1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
KLHL22Q53GT1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
KLHL22Q53GT1 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
KLHL22Q53GT1 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
KLHL22Q53GT1 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
KLHL22Q53GT1 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
KLHL22Q53GT1 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
KLHL22Q53GT1 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
KLHL22Q53GT1 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
KLHL22Q53GT1 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
KLHL22Q53GT1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
KLHL22Q53GT1 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL22Q53GT1 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL22Q53GT1 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL22Q53GT1 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL22Q53GT1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL22Q53GT1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL22Q53GT1 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL22Q53GT1 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL22Q53GT1 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL22Q53GT1 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL22Q53GT1 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL22Q53GT1 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLHL22Q53GT1 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLHL22Q53GT1 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLHL22Q53GT1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLHL22Q53GT1 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLHL22Q53GT1 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLHL22Q53GT1 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLHL22Q53GT1 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
KLHL22Q53GT1 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLHL22Q53GT1 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLHL22Q53GT1 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLHL22Q53GT1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLHL22Q53GT1 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLHL22Q53GT1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
KLHL22Q53GT1 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLHL22Q53GT1 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLHL22Q53GT1 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms