Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDE5

SVEP1, Sushi, von Willebrand factor type A, EGF and pentraxin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 3,571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVEP1Q4LDE5 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SVEP1Q4LDE5 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SVEP1Q4LDE5 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SVEP1Q4LDE5 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SVEP1Q4LDE5 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SVEP1Q4LDE5 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SVEP1Q4LDE5 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SVEP1Q4LDE5 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SVEP1Q4LDE5 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SVEP1Q4LDE5 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SVEP1Q4LDE5 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SVEP1Q4LDE5 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SVEP1Q4LDE5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SVEP1Q4LDE5 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SVEP1Q4LDE5 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SVEP1Q4LDE5 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SVEP1Q4LDE5 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SVEP1Q4LDE5 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SVEP1Q4LDE5 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SVEP1Q4LDE5 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SVEP1Q4LDE5 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SVEP1Q4LDE5 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SVEP1Q4LDE5 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SVEP1Q4LDE5 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SVEP1Q4LDE5 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SVEP1Q4LDE5 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SVEP1Q4LDE5 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SVEP1Q4LDE5 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SVEP1Q4LDE5 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SVEP1Q4LDE5 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SVEP1Q4LDE5 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SVEP1Q4LDE5 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SVEP1Q4LDE5 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SVEP1Q4LDE5 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SVEP1Q4LDE5 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SVEP1Q4LDE5 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SVEP1Q4LDE5 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SVEP1Q4LDE5 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SVEP1Q4LDE5 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SVEP1Q4LDE5 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SVEP1Q4LDE5 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SVEP1Q4LDE5 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SVEP1Q4LDE5 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SVEP1Q4LDE5 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SVEP1Q4LDE5 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SVEP1Q4LDE5 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SVEP1Q4LDE5 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SVEP1Q4LDE5 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SVEP1Q4LDE5 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SVEP1Q4LDE5 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SVEP1Q4LDE5 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SVEP1Q4LDE5 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SVEP1Q4LDE5 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SVEP1Q4LDE5 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SVEP1Q4LDE5 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SVEP1Q4LDE5 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SVEP1Q4LDE5 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SVEP1Q4LDE5 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SVEP1Q4LDE5 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SVEP1Q4LDE5 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SVEP1Q4LDE5 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SVEP1Q4LDE5 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SVEP1Q4LDE5 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SVEP1Q4LDE5 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SVEP1Q4LDE5 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SVEP1Q4LDE5 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SVEP1Q4LDE5 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SVEP1Q4LDE5 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SVEP1Q4LDE5 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SVEP1Q4LDE5 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SVEP1Q4LDE5 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SVEP1Q4LDE5 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SVEP1Q4LDE5 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SVEP1Q4LDE5 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SVEP1Q4LDE5 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SVEP1Q4LDE5 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SVEP1Q4LDE5 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SVEP1Q4LDE5 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SVEP1Q4LDE5 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SVEP1Q4LDE5 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SVEP1Q4LDE5 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SVEP1Q4LDE5 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SVEP1Q4LDE5 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SVEP1Q4LDE5 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SVEP1Q4LDE5 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SVEP1Q4LDE5 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SVEP1Q4LDE5 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SVEP1Q4LDE5 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SVEP1Q4LDE5 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SVEP1Q4LDE5 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SVEP1Q4LDE5 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SVEP1Q4LDE5 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SVEP1Q4LDE5 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SVEP1Q4LDE5 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SVEP1Q4LDE5 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SVEP1Q4LDE5 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SVEP1Q4LDE5 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SVEP1Q4LDE5 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SVEP1Q4LDE5 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SVEP1Q4LDE5 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms