Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN1

KRTAP21-3, Keratin-associated protein 21-3, humanhuman

Predictions only

Length 58 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-3Q3LHN1 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRTAP21-3Q3LHN1 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms