Protein–RNA interactions for Protein: Q2T9J0

TYSND1, Peroxisomal leader peptide-processing protease, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYSND1Q2T9J0 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TYSND1Q2T9J0 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TYSND1Q2T9J0 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TYSND1Q2T9J0 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TYSND1Q2T9J0 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TYSND1Q2T9J0 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TYSND1Q2T9J0 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
TYSND1Q2T9J0 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TYSND1Q2T9J0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TYSND1Q2T9J0 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TYSND1Q2T9J0 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TYSND1Q2T9J0 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TYSND1Q2T9J0 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TYSND1Q2T9J0 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TYSND1Q2T9J0 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TYSND1Q2T9J0 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TYSND1Q2T9J0 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TYSND1Q2T9J0 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TYSND1Q2T9J0 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TYSND1Q2T9J0 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TYSND1Q2T9J0 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TYSND1Q2T9J0 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TYSND1Q2T9J0 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TYSND1Q2T9J0 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TYSND1Q2T9J0 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TYSND1Q2T9J0 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TYSND1Q2T9J0 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TYSND1Q2T9J0 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TYSND1Q2T9J0 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TYSND1Q2T9J0 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TYSND1Q2T9J0 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TYSND1Q2T9J0 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TYSND1Q2T9J0 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
TYSND1Q2T9J0 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
TYSND1Q2T9J0 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TYSND1Q2T9J0 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TYSND1Q2T9J0 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TYSND1Q2T9J0 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TYSND1Q2T9J0 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TYSND1Q2T9J0 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TYSND1Q2T9J0 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TYSND1Q2T9J0 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TYSND1Q2T9J0 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TYSND1Q2T9J0 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TYSND1Q2T9J0 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
TYSND1Q2T9J0 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
TYSND1Q2T9J0 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TYSND1Q2T9J0 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TYSND1Q2T9J0 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TYSND1Q2T9J0 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TYSND1Q2T9J0 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TYSND1Q2T9J0 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TYSND1Q2T9J0 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TYSND1Q2T9J0 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TYSND1Q2T9J0 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TYSND1Q2T9J0 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TYSND1Q2T9J0 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TYSND1Q2T9J0 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TYSND1Q2T9J0 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TYSND1Q2T9J0 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TYSND1Q2T9J0 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TYSND1Q2T9J0 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TYSND1Q2T9J0 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TYSND1Q2T9J0 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TYSND1Q2T9J0 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TYSND1Q2T9J0 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TYSND1Q2T9J0 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TYSND1Q2T9J0 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TYSND1Q2T9J0 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TYSND1Q2T9J0 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TYSND1Q2T9J0 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TYSND1Q2T9J0 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TYSND1Q2T9J0 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TYSND1Q2T9J0 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TYSND1Q2T9J0 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TYSND1Q2T9J0 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TYSND1Q2T9J0 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TYSND1Q2T9J0 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TYSND1Q2T9J0 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TYSND1Q2T9J0 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TYSND1Q2T9J0 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TYSND1Q2T9J0 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TYSND1Q2T9J0 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TYSND1Q2T9J0 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TYSND1Q2T9J0 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TYSND1Q2T9J0 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TYSND1Q2T9J0 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TYSND1Q2T9J0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TYSND1Q2T9J0 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TYSND1Q2T9J0 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TYSND1Q2T9J0 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TYSND1Q2T9J0 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TYSND1Q2T9J0 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TYSND1Q2T9J0 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TYSND1Q2T9J0 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TYSND1Q2T9J0 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TYSND1Q2T9J0 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TYSND1Q2T9J0 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TYSND1Q2T9J0 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TYSND1Q2T9J0 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms