Protein–RNA interactions for Protein: Q2Q1W2

TRIM71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 868 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM71Q2Q1W2 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM71Q2Q1W2 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM71Q2Q1W2 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM71Q2Q1W2 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TRIM71Q2Q1W2 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM71Q2Q1W2 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TRIM71Q2Q1W2 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TRIM71Q2Q1W2 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM71Q2Q1W2 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM71Q2Q1W2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM71Q2Q1W2 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM71Q2Q1W2 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM71Q2Q1W2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM71Q2Q1W2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM71Q2Q1W2 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM71Q2Q1W2 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM71Q2Q1W2 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM71Q2Q1W2 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM71Q2Q1W2 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM71Q2Q1W2 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM71Q2Q1W2 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM71Q2Q1W2 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM71Q2Q1W2 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM71Q2Q1W2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM71Q2Q1W2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM71Q2Q1W2 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM71Q2Q1W2 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM71Q2Q1W2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM71Q2Q1W2 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM71Q2Q1W2 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM71Q2Q1W2 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM71Q2Q1W2 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM71Q2Q1W2 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM71Q2Q1W2 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM71Q2Q1W2 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM71Q2Q1W2 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM71Q2Q1W2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM71Q2Q1W2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM71Q2Q1W2 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM71Q2Q1W2 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM71Q2Q1W2 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM71Q2Q1W2 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM71Q2Q1W2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM71Q2Q1W2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM71Q2Q1W2 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM71Q2Q1W2 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM71Q2Q1W2 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM71Q2Q1W2 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM71Q2Q1W2 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM71Q2Q1W2 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM71Q2Q1W2 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM71Q2Q1W2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM71Q2Q1W2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM71Q2Q1W2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM71Q2Q1W2 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM71Q2Q1W2 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM71Q2Q1W2 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM71Q2Q1W2 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM71Q2Q1W2 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM71Q2Q1W2 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM71Q2Q1W2 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM71Q2Q1W2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM71Q2Q1W2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM71Q2Q1W2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM71Q2Q1W2 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM71Q2Q1W2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM71Q2Q1W2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM71Q2Q1W2 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM71Q2Q1W2 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM71Q2Q1W2 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM71Q2Q1W2 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM71Q2Q1W2 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM71Q2Q1W2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM71Q2Q1W2 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM71Q2Q1W2 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM71Q2Q1W2 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM71Q2Q1W2 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM71Q2Q1W2 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM71Q2Q1W2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM71Q2Q1W2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM71Q2Q1W2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM71Q2Q1W2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM71Q2Q1W2 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM71Q2Q1W2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM71Q2Q1W2 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM71Q2Q1W2 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM71Q2Q1W2 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM71Q2Q1W2 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM71Q2Q1W2 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM71Q2Q1W2 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM71Q2Q1W2 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM71Q2Q1W2 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM71Q2Q1W2 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM71Q2Q1W2 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM71Q2Q1W2 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM71Q2Q1W2 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM71Q2Q1W2 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM71Q2Q1W2 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM71Q2Q1W2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM71Q2Q1W2 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms