Protein–RNA interactions for Protein: Q2M1V0

ISX, Intestine-specific homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISXQ2M1V0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ISXQ2M1V0 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ISXQ2M1V0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ISXQ2M1V0 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ISXQ2M1V0 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ISXQ2M1V0 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ISXQ2M1V0 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ISXQ2M1V0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ISXQ2M1V0 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ISXQ2M1V0 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ISXQ2M1V0 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ISXQ2M1V0 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ISXQ2M1V0 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ISXQ2M1V0 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ISXQ2M1V0 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ISXQ2M1V0 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ISXQ2M1V0 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ISXQ2M1V0 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ISXQ2M1V0 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ISXQ2M1V0 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ISXQ2M1V0 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ISXQ2M1V0 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ISXQ2M1V0 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ISXQ2M1V0 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ISXQ2M1V0 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ISXQ2M1V0 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ISXQ2M1V0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ISXQ2M1V0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ISXQ2M1V0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ISXQ2M1V0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ISXQ2M1V0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ISXQ2M1V0 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ISXQ2M1V0 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ISXQ2M1V0 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ISXQ2M1V0 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ISXQ2M1V0 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ISXQ2M1V0 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ISXQ2M1V0 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ISXQ2M1V0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ISXQ2M1V0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ISXQ2M1V0 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ISXQ2M1V0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ISXQ2M1V0 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ISXQ2M1V0 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ISXQ2M1V0 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ISXQ2M1V0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ISXQ2M1V0 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ISXQ2M1V0 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ISXQ2M1V0 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ISXQ2M1V0 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ISXQ2M1V0 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ISXQ2M1V0 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ISXQ2M1V0 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ISXQ2M1V0 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ISXQ2M1V0 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ISXQ2M1V0 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ISXQ2M1V0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ISXQ2M1V0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ISXQ2M1V0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ISXQ2M1V0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ISXQ2M1V0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ISXQ2M1V0 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ISXQ2M1V0 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ISXQ2M1V0 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ISXQ2M1V0 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ISXQ2M1V0 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ISXQ2M1V0 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ISXQ2M1V0 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ISXQ2M1V0 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ISXQ2M1V0 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ISXQ2M1V0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ISXQ2M1V0 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ISXQ2M1V0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ISXQ2M1V0 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ISXQ2M1V0 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ISXQ2M1V0 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ISXQ2M1V0 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ISXQ2M1V0 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ISXQ2M1V0 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ISXQ2M1V0 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ISXQ2M1V0 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ISXQ2M1V0 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ISXQ2M1V0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ISXQ2M1V0 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ISXQ2M1V0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ISXQ2M1V0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ISXQ2M1V0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ISXQ2M1V0 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ISXQ2M1V0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ISXQ2M1V0 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ISXQ2M1V0 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ISXQ2M1V0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ISXQ2M1V0 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ISXQ2M1V0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ISXQ2M1V0 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ISXQ2M1V0 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ISXQ2M1V0 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ISXQ2M1V0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ISXQ2M1V0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ISXQ2M1V0 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms