Protein–RNA interactions for Protein: Q17RP2

TIGD6, Tigger transposable element-derived protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIGD6Q17RP2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TIGD6Q17RP2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TIGD6Q17RP2 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TIGD6Q17RP2 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TIGD6Q17RP2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TIGD6Q17RP2 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TIGD6Q17RP2 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TIGD6Q17RP2 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TIGD6Q17RP2 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TIGD6Q17RP2 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TIGD6Q17RP2 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TIGD6Q17RP2 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TIGD6Q17RP2 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TIGD6Q17RP2 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TIGD6Q17RP2 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TIGD6Q17RP2 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TIGD6Q17RP2 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TIGD6Q17RP2 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TIGD6Q17RP2 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TIGD6Q17RP2 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TIGD6Q17RP2 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TIGD6Q17RP2 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TIGD6Q17RP2 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TIGD6Q17RP2 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TIGD6Q17RP2 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TIGD6Q17RP2 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TIGD6Q17RP2 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TIGD6Q17RP2 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TIGD6Q17RP2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TIGD6Q17RP2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TIGD6Q17RP2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TIGD6Q17RP2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TIGD6Q17RP2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TIGD6Q17RP2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TIGD6Q17RP2 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TIGD6Q17RP2 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TIGD6Q17RP2 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TIGD6Q17RP2 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TIGD6Q17RP2 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TIGD6Q17RP2 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TIGD6Q17RP2 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TIGD6Q17RP2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TIGD6Q17RP2 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TIGD6Q17RP2 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TIGD6Q17RP2 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TIGD6Q17RP2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TIGD6Q17RP2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TIGD6Q17RP2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TIGD6Q17RP2 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TIGD6Q17RP2 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TIGD6Q17RP2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TIGD6Q17RP2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TIGD6Q17RP2 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TIGD6Q17RP2 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
TIGD6Q17RP2 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TIGD6Q17RP2 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
TIGD6Q17RP2 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TIGD6Q17RP2 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TIGD6Q17RP2 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TIGD6Q17RP2 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TIGD6Q17RP2 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TIGD6Q17RP2 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TIGD6Q17RP2 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TIGD6Q17RP2 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TIGD6Q17RP2 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TIGD6Q17RP2 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TIGD6Q17RP2 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TIGD6Q17RP2 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TIGD6Q17RP2 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TIGD6Q17RP2 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TIGD6Q17RP2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TIGD6Q17RP2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TIGD6Q17RP2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TIGD6Q17RP2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TIGD6Q17RP2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TIGD6Q17RP2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TIGD6Q17RP2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TIGD6Q17RP2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TIGD6Q17RP2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TIGD6Q17RP2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TIGD6Q17RP2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TIGD6Q17RP2 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TIGD6Q17RP2 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TIGD6Q17RP2 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TIGD6Q17RP2 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TIGD6Q17RP2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TIGD6Q17RP2 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TIGD6Q17RP2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TIGD6Q17RP2 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TIGD6Q17RP2 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TIGD6Q17RP2 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
TIGD6Q17RP2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TIGD6Q17RP2 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TIGD6Q17RP2 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TIGD6Q17RP2 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TIGD6Q17RP2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TIGD6Q17RP2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
TIGD6Q17RP2 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TIGD6Q17RP2 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TIGD6Q17RP2 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms