Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM187BQ17R55 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM187BQ17R55 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM187BQ17R55 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM187BQ17R55 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM187BQ17R55 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM187BQ17R55 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM187BQ17R55 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM187BQ17R55 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM187BQ17R55 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM187BQ17R55 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM187BQ17R55 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM187BQ17R55 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM187BQ17R55 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM187BQ17R55 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM187BQ17R55 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM187BQ17R55 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM187BQ17R55 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM187BQ17R55 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM187BQ17R55 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM187BQ17R55 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM187BQ17R55 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM187BQ17R55 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM187BQ17R55 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM187BQ17R55 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM187BQ17R55 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM187BQ17R55 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM187BQ17R55 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM187BQ17R55 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM187BQ17R55 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM187BQ17R55 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM187BQ17R55 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM187BQ17R55 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM187BQ17R55 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM187BQ17R55 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM187BQ17R55 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM187BQ17R55 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM187BQ17R55 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM187BQ17R55 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM187BQ17R55 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM187BQ17R55 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM187BQ17R55 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM187BQ17R55 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM187BQ17R55 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM187BQ17R55 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM187BQ17R55 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM187BQ17R55 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM187BQ17R55 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM187BQ17R55 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM187BQ17R55 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM187BQ17R55 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM187BQ17R55 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM187BQ17R55 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM187BQ17R55 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM187BQ17R55 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM187BQ17R55 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
FAM187BQ17R55 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FAM187BQ17R55 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FAM187BQ17R55 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FAM187BQ17R55 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FAM187BQ17R55 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
FAM187BQ17R55 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM187BQ17R55 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM187BQ17R55 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM187BQ17R55 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM187BQ17R55 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM187BQ17R55 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM187BQ17R55 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM187BQ17R55 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM187BQ17R55 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM187BQ17R55 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM187BQ17R55 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM187BQ17R55 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM187BQ17R55 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM187BQ17R55 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM187BQ17R55 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM187BQ17R55 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM187BQ17R55 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM187BQ17R55 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM187BQ17R55 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM187BQ17R55 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM187BQ17R55 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM187BQ17R55 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM187BQ17R55 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM187BQ17R55 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM187BQ17R55 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM187BQ17R55 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM187BQ17R55 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM187BQ17R55 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM187BQ17R55 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM187BQ17R55 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM187BQ17R55 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM187BQ17R55 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM187BQ17R55 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM187BQ17R55 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM187BQ17R55 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM187BQ17R55 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM187BQ17R55 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM187BQ17R55 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM187BQ17R55 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms