Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRNQ16849 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRNQ16849 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRNQ16849 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRNQ16849 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRNQ16849 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRNQ16849 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRNQ16849 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRNQ16849 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRNQ16849 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRNQ16849 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRNQ16849 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRNQ16849 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRNQ16849 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRNQ16849 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRNQ16849 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRNQ16849 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRNQ16849 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRNQ16849 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.03
PTPRNQ16849 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PTPRNQ16849 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRNQ16849 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRNQ16849 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRNQ16849 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRNQ16849 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRNQ16849 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRNQ16849 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRNQ16849 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRNQ16849 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRNQ16849 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRNQ16849 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRNQ16849 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRNQ16849 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRNQ16849 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRNQ16849 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRNQ16849 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRNQ16849 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRNQ16849 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRNQ16849 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRNQ16849 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRNQ16849 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRNQ16849 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRNQ16849 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRNQ16849 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRNQ16849 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRNQ16849 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRNQ16849 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRNQ16849 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRNQ16849 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRNQ16849 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRNQ16849 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRNQ16849 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRNQ16849 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRNQ16849 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRNQ16849 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRNQ16849 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRNQ16849 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRNQ16849 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRNQ16849 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRNQ16849 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRNQ16849 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRNQ16849 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRNQ16849 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRNQ16849 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRNQ16849 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRNQ16849 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRNQ16849 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRNQ16849 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRNQ16849 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRNQ16849 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRNQ16849 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRNQ16849 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRNQ16849 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRNQ16849 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRNQ16849 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRNQ16849 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRNQ16849 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRNQ16849 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRNQ16849 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRNQ16849 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRNQ16849 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRNQ16849 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRNQ16849 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRNQ16849 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRNQ16849 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRNQ16849 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRNQ16849 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRNQ16849 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRNQ16849 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRNQ16849 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRNQ16849 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRNQ16849 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRNQ16849 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRNQ16849 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRNQ16849 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRNQ16849 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRNQ16849 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRNQ16849 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRNQ16849 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRNQ16849 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
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