Protein–RNA interactions for Protein: Q16828

DUSP6, Dual specificity protein phosphatase 6, humanhuman

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Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP6Q16828 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DUSP6Q16828 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DUSP6Q16828 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DUSP6Q16828 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DUSP6Q16828 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DUSP6Q16828 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DUSP6Q16828 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DUSP6Q16828 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DUSP6Q16828 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DUSP6Q16828 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DUSP6Q16828 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DUSP6Q16828 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DUSP6Q16828 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DUSP6Q16828 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DUSP6Q16828 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DUSP6Q16828 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DUSP6Q16828 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
DUSP6Q16828 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DUSP6Q16828 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
DUSP6Q16828 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DUSP6Q16828 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
DUSP6Q16828 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DUSP6Q16828 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DUSP6Q16828 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DUSP6Q16828 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DUSP6Q16828 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DUSP6Q16828 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DUSP6Q16828 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DUSP6Q16828 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DUSP6Q16828 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
DUSP6Q16828 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DUSP6Q16828 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DUSP6Q16828 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DUSP6Q16828 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DUSP6Q16828 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DUSP6Q16828 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DUSP6Q16828 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DUSP6Q16828 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DUSP6Q16828 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DUSP6Q16828 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DUSP6Q16828 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DUSP6Q16828 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DUSP6Q16828 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DUSP6Q16828 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DUSP6Q16828 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DUSP6Q16828 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DUSP6Q16828 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DUSP6Q16828 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DUSP6Q16828 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DUSP6Q16828 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
DUSP6Q16828 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DUSP6Q16828 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DUSP6Q16828 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DUSP6Q16828 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DUSP6Q16828 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DUSP6Q16828 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DUSP6Q16828 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
DUSP6Q16828 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DUSP6Q16828 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DUSP6Q16828 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
DUSP6Q16828 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
DUSP6Q16828 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DUSP6Q16828 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DUSP6Q16828 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DUSP6Q16828 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DUSP6Q16828 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DUSP6Q16828 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DUSP6Q16828 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DUSP6Q16828 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DUSP6Q16828 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DUSP6Q16828 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DUSP6Q16828 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DUSP6Q16828 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DUSP6Q16828 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DUSP6Q16828 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DUSP6Q16828 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DUSP6Q16828 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DUSP6Q16828 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DUSP6Q16828 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DUSP6Q16828 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DUSP6Q16828 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DUSP6Q16828 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DUSP6Q16828 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DUSP6Q16828 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DUSP6Q16828 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DUSP6Q16828 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DUSP6Q16828 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DUSP6Q16828 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DUSP6Q16828 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
DUSP6Q16828 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DUSP6Q16828 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DUSP6Q16828 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DUSP6Q16828 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
DUSP6Q16828 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DUSP6Q16828 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DUSP6Q16828 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DUSP6Q16828 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DUSP6Q16828 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DUSP6Q16828 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DUSP6Q16828 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
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