Protein–RNA interactions for Protein: Q16553

LY6E, Lymphocyte antigen 6E, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY6EQ16553 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LY6EQ16553 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
LY6EQ16553 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
LY6EQ16553 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LY6EQ16553 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LY6EQ16553 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LY6EQ16553 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LY6EQ16553 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LY6EQ16553 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LY6EQ16553 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
LY6EQ16553 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LY6EQ16553 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
LY6EQ16553 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LY6EQ16553 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LY6EQ16553 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LY6EQ16553 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LY6EQ16553 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LY6EQ16553 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LY6EQ16553 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LY6EQ16553 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LY6EQ16553 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LY6EQ16553 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LY6EQ16553 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LY6EQ16553 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
LY6EQ16553 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LY6EQ16553 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LY6EQ16553 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LY6EQ16553 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
LY6EQ16553 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LY6EQ16553 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LY6EQ16553 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LY6EQ16553 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LY6EQ16553 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LY6EQ16553 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LY6EQ16553 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LY6EQ16553 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LY6EQ16553 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LY6EQ16553 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LY6EQ16553 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LY6EQ16553 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LY6EQ16553 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LY6EQ16553 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LY6EQ16553 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LY6EQ16553 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LY6EQ16553 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LY6EQ16553 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
LY6EQ16553 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LY6EQ16553 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LY6EQ16553 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
LY6EQ16553 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
LY6EQ16553 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LY6EQ16553 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LY6EQ16553 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LY6EQ16553 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LY6EQ16553 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LY6EQ16553 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LY6EQ16553 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LY6EQ16553 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LY6EQ16553 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LY6EQ16553 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LY6EQ16553 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LY6EQ16553 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
LY6EQ16553 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LY6EQ16553 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LY6EQ16553 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LY6EQ16553 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LY6EQ16553 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LY6EQ16553 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LY6EQ16553 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LY6EQ16553 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
LY6EQ16553 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LY6EQ16553 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LY6EQ16553 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LY6EQ16553 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LY6EQ16553 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LY6EQ16553 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LY6EQ16553 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LY6EQ16553 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LY6EQ16553 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LY6EQ16553 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LY6EQ16553 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
LY6EQ16553 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LY6EQ16553 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LY6EQ16553 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LY6EQ16553 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LY6EQ16553 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LY6EQ16553 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LY6EQ16553 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LY6EQ16553 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LY6EQ16553 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LY6EQ16553 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
LY6EQ16553 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LY6EQ16553 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LY6EQ16553 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LY6EQ16553 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LY6EQ16553 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LY6EQ16553 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LY6EQ16553 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LY6EQ16553 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LY6EQ16553 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms