Protein–RNA interactions for Protein: Q16385

SSX2, Protein SSX2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX2Q16385 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSX2Q16385 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSX2Q16385 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSX2Q16385 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSX2Q16385 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSX2Q16385 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSX2Q16385 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSX2Q16385 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSX2Q16385 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSX2Q16385 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSX2Q16385 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSX2Q16385 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSX2Q16385 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSX2Q16385 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSX2Q16385 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSX2Q16385 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSX2Q16385 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSX2Q16385 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSX2Q16385 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSX2Q16385 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSX2Q16385 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSX2Q16385 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSX2Q16385 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSX2Q16385 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSX2Q16385 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSX2Q16385 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSX2Q16385 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSX2Q16385 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSX2Q16385 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSX2Q16385 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSX2Q16385 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSX2Q16385 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSX2Q16385 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSX2Q16385 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSX2Q16385 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSX2Q16385 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSX2Q16385 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSX2Q16385 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSX2Q16385 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSX2Q16385 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSX2Q16385 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSX2Q16385 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSX2Q16385 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSX2Q16385 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSX2Q16385 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSX2Q16385 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSX2Q16385 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSX2Q16385 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSX2Q16385 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSX2Q16385 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSX2Q16385 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SSX2Q16385 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSX2Q16385 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSX2Q16385 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSX2Q16385 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSX2Q16385 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSX2Q16385 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSX2Q16385 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSX2Q16385 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSX2Q16385 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSX2Q16385 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSX2Q16385 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SSX2Q16385 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SSX2Q16385 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SSX2Q16385 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
SSX2Q16385 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SSX2Q16385 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SSX2Q16385 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SSX2Q16385 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SSX2Q16385 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SSX2Q16385 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SSX2Q16385 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SSX2Q16385 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SSX2Q16385 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SSX2Q16385 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SSX2Q16385 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SSX2Q16385 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SSX2Q16385 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SSX2Q16385 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SSX2Q16385 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SSX2Q16385 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SSX2Q16385 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SSX2Q16385 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SSX2Q16385 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SSX2Q16385 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SSX2Q16385 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SSX2Q16385 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SSX2Q16385 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSX2Q16385 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSX2Q16385 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSX2Q16385 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSX2Q16385 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSX2Q16385 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSX2Q16385 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSX2Q16385 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSX2Q16385 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSX2Q16385 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSX2Q16385 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSX2Q16385 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSX2Q16385 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
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