Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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VAMP3Q15836 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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VAMP3Q15836 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VAMP3Q15836 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VAMP3Q15836 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VAMP3Q15836 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VAMP3Q15836 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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VAMP3Q15836 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VAMP3Q15836 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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VAMP3Q15836 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VAMP3Q15836 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
VAMP3Q15836 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VAMP3Q15836 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VAMP3Q15836 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VAMP3Q15836 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VAMP3Q15836 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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