Protein–RNA interactions for Protein: Q15653

NFKBIB, NF-kappa-B inhibitor beta, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIBQ15653 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NFKBIBQ15653 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NFKBIBQ15653 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NFKBIBQ15653 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NFKBIBQ15653 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NFKBIBQ15653 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NFKBIBQ15653 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NFKBIBQ15653 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NFKBIBQ15653 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NFKBIBQ15653 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NFKBIBQ15653 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NFKBIBQ15653 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NFKBIBQ15653 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NFKBIBQ15653 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NFKBIBQ15653 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NFKBIBQ15653 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NFKBIBQ15653 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NFKBIBQ15653 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NFKBIBQ15653 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NFKBIBQ15653 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NFKBIBQ15653 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NFKBIBQ15653 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NFKBIBQ15653 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NFKBIBQ15653 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NFKBIBQ15653 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NFKBIBQ15653 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NFKBIBQ15653 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NFKBIBQ15653 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NFKBIBQ15653 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NFKBIBQ15653 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NFKBIBQ15653 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NFKBIBQ15653 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NFKBIBQ15653 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NFKBIBQ15653 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NFKBIBQ15653 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NFKBIBQ15653 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NFKBIBQ15653 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NFKBIBQ15653 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NFKBIBQ15653 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NFKBIBQ15653 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NFKBIBQ15653 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NFKBIBQ15653 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NFKBIBQ15653 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NFKBIBQ15653 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NFKBIBQ15653 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NFKBIBQ15653 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NFKBIBQ15653 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NFKBIBQ15653 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NFKBIBQ15653 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NFKBIBQ15653 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NFKBIBQ15653 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NFKBIBQ15653 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NFKBIBQ15653 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NFKBIBQ15653 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NFKBIBQ15653 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NFKBIBQ15653 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NFKBIBQ15653 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NFKBIBQ15653 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NFKBIBQ15653 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NFKBIBQ15653 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NFKBIBQ15653 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
NFKBIBQ15653 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NFKBIBQ15653 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NFKBIBQ15653 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NFKBIBQ15653 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NFKBIBQ15653 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NFKBIBQ15653 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NFKBIBQ15653 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NFKBIBQ15653 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NFKBIBQ15653 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NFKBIBQ15653 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NFKBIBQ15653 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NFKBIBQ15653 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NFKBIBQ15653 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NFKBIBQ15653 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NFKBIBQ15653 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NFKBIBQ15653 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NFKBIBQ15653 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NFKBIBQ15653 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NFKBIBQ15653 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NFKBIBQ15653 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NFKBIBQ15653 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NFKBIBQ15653 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NFKBIBQ15653 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NFKBIBQ15653 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NFKBIBQ15653 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NFKBIBQ15653 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NFKBIBQ15653 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NFKBIBQ15653 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NFKBIBQ15653 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NFKBIBQ15653 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NFKBIBQ15653 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NFKBIBQ15653 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NFKBIBQ15653 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NFKBIBQ15653 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NFKBIBQ15653 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NFKBIBQ15653 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NFKBIBQ15653 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NFKBIBQ15653 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NFKBIBQ15653 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms