Protein–RNA interactions for Protein: Q15526

SURF1, Surfeit locus protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF1Q15526 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SURF1Q15526 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SURF1Q15526 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SURF1Q15526 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SURF1Q15526 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SURF1Q15526 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SURF1Q15526 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SURF1Q15526 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SURF1Q15526 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SURF1Q15526 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SURF1Q15526 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SURF1Q15526 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SURF1Q15526 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SURF1Q15526 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SURF1Q15526 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SURF1Q15526 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SURF1Q15526 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SURF1Q15526 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SURF1Q15526 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SURF1Q15526 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SURF1Q15526 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SURF1Q15526 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SURF1Q15526 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SURF1Q15526 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SURF1Q15526 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SURF1Q15526 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SURF1Q15526 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SURF1Q15526 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SURF1Q15526 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SURF1Q15526 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SURF1Q15526 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SURF1Q15526 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SURF1Q15526 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SURF1Q15526 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SURF1Q15526 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SURF1Q15526 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SURF1Q15526 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SURF1Q15526 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SURF1Q15526 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SURF1Q15526 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SURF1Q15526 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SURF1Q15526 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SURF1Q15526 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SURF1Q15526 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SURF1Q15526 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SURF1Q15526 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SURF1Q15526 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SURF1Q15526 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SURF1Q15526 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SURF1Q15526 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SURF1Q15526 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SURF1Q15526 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SURF1Q15526 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SURF1Q15526 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SURF1Q15526 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SURF1Q15526 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SURF1Q15526 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SURF1Q15526 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SURF1Q15526 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SURF1Q15526 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SURF1Q15526 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SURF1Q15526 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SURF1Q15526 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SURF1Q15526 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SURF1Q15526 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SURF1Q15526 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SURF1Q15526 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SURF1Q15526 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SURF1Q15526 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SURF1Q15526 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SURF1Q15526 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SURF1Q15526 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SURF1Q15526 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SURF1Q15526 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SURF1Q15526 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SURF1Q15526 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SURF1Q15526 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SURF1Q15526 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SURF1Q15526 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SURF1Q15526 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SURF1Q15526 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SURF1Q15526 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SURF1Q15526 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SURF1Q15526 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SURF1Q15526 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SURF1Q15526 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SURF1Q15526 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SURF1Q15526 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SURF1Q15526 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SURF1Q15526 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SURF1Q15526 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SURF1Q15526 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SURF1Q15526 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SURF1Q15526 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SURF1Q15526 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SURF1Q15526 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SURF1Q15526 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SURF1Q15526 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SURF1Q15526 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SURF1Q15526 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms