Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NKX1-1Q15270 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NKX1-1Q15270 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NKX1-1Q15270 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NKX1-1Q15270 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NKX1-1Q15270 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NKX1-1Q15270 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
NKX1-1Q15270 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NKX1-1Q15270 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NKX1-1Q15270 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NKX1-1Q15270 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
NKX1-1Q15270 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NKX1-1Q15270 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NKX1-1Q15270 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NKX1-1Q15270 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NKX1-1Q15270 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NKX1-1Q15270 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NKX1-1Q15270 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NKX1-1Q15270 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NKX1-1Q15270 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NKX1-1Q15270 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NKX1-1Q15270 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NKX1-1Q15270 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NKX1-1Q15270 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NKX1-1Q15270 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NKX1-1Q15270 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NKX1-1Q15270 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NKX1-1Q15270 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NKX1-1Q15270 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NKX1-1Q15270 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NKX1-1Q15270 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NKX1-1Q15270 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NKX1-1Q15270 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NKX1-1Q15270 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
NKX1-1Q15270 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
NKX1-1Q15270 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NKX1-1Q15270 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NKX1-1Q15270 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
NKX1-1Q15270 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
NKX1-1Q15270 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NKX1-1Q15270 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NKX1-1Q15270 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NKX1-1Q15270 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NKX1-1Q15270 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
NKX1-1Q15270 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
NKX1-1Q15270 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NKX1-1Q15270 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NKX1-1Q15270 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NKX1-1Q15270 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NKX1-1Q15270 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NKX1-1Q15270 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NKX1-1Q15270 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NKX1-1Q15270 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NKX1-1Q15270 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NKX1-1Q15270 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NKX1-1Q15270 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NKX1-1Q15270 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NKX1-1Q15270 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NKX1-1Q15270 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NKX1-1Q15270 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NKX1-1Q15270 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NKX1-1Q15270 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NKX1-1Q15270 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NKX1-1Q15270 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NKX1-1Q15270 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NKX1-1Q15270 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NKX1-1Q15270 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NKX1-1Q15270 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NKX1-1Q15270 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NKX1-1Q15270 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NKX1-1Q15270 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NKX1-1Q15270 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
NKX1-1Q15270 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
NKX1-1Q15270 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
NKX1-1Q15270 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NKX1-1Q15270 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NKX1-1Q15270 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NKX1-1Q15270 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NKX1-1Q15270 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NKX1-1Q15270 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NKX1-1Q15270 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NKX1-1Q15270 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NKX1-1Q15270 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NKX1-1Q15270 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NKX1-1Q15270 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
NKX1-1Q15270 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NKX1-1Q15270 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NKX1-1Q15270 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NKX1-1Q15270 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NKX1-1Q15270 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
NKX1-1Q15270 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NKX1-1Q15270 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NKX1-1Q15270 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NKX1-1Q15270 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NKX1-1Q15270 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NKX1-1Q15270 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
NKX1-1Q15270 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NKX1-1Q15270 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NKX1-1Q15270 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NKX1-1Q15270 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms