Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SHPRHQ149N8 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SHPRHQ149N8 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
SHPRHQ149N8 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SHPRHQ149N8 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SHPRHQ149N8 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
SHPRHQ149N8 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SHPRHQ149N8 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SHPRHQ149N8 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SHPRHQ149N8 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SHPRHQ149N8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SHPRHQ149N8 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SHPRHQ149N8 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SHPRHQ149N8 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SHPRHQ149N8 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SHPRHQ149N8 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SHPRHQ149N8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SHPRHQ149N8 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SHPRHQ149N8 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SHPRHQ149N8 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SHPRHQ149N8 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SHPRHQ149N8 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SHPRHQ149N8 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SHPRHQ149N8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.27
SHPRHQ149N8 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SHPRHQ149N8 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SHPRHQ149N8 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SHPRHQ149N8 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SHPRHQ149N8 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SHPRHQ149N8 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
SHPRHQ149N8 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SHPRHQ149N8 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SHPRHQ149N8 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SHPRHQ149N8 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
SHPRHQ149N8 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SHPRHQ149N8 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SHPRHQ149N8 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SHPRHQ149N8 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SHPRHQ149N8 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SHPRHQ149N8 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SHPRHQ149N8 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SHPRHQ149N8 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SHPRHQ149N8 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SHPRHQ149N8 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SHPRHQ149N8 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SHPRHQ149N8 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SHPRHQ149N8 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SHPRHQ149N8 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SHPRHQ149N8 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SHPRHQ149N8 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SHPRHQ149N8 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SHPRHQ149N8 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SHPRHQ149N8 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
SHPRHQ149N8 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SHPRHQ149N8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SHPRHQ149N8 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SHPRHQ149N8 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SHPRHQ149N8 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SHPRHQ149N8 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SHPRHQ149N8 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SHPRHQ149N8 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SHPRHQ149N8 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SHPRHQ149N8 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SHPRHQ149N8 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SHPRHQ149N8 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SHPRHQ149N8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SHPRHQ149N8 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SHPRHQ149N8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SHPRHQ149N8 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SHPRHQ149N8 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SHPRHQ149N8 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SHPRHQ149N8 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SHPRHQ149N8 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SHPRHQ149N8 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SHPRHQ149N8 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SHPRHQ149N8 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
SHPRHQ149N8 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SHPRHQ149N8 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SHPRHQ149N8 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SHPRHQ149N8 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SHPRHQ149N8 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SHPRHQ149N8 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SHPRHQ149N8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SHPRHQ149N8 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SHPRHQ149N8 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SHPRHQ149N8 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SHPRHQ149N8 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SHPRHQ149N8 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SHPRHQ149N8 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SHPRHQ149N8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
SHPRHQ149N8 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SHPRHQ149N8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SHPRHQ149N8 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SHPRHQ149N8 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SHPRHQ149N8 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SHPRHQ149N8 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SHPRHQ149N8 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
SHPRHQ149N8 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SHPRHQ149N8 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SHPRHQ149N8 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
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