Protein–RNA interactions for Protein: Q14676

MDC1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDC1Q14676 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MDC1Q14676 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MDC1Q14676 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
MDC1Q14676 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MDC1Q14676 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MDC1Q14676 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MDC1Q14676 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MDC1Q14676 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MDC1Q14676 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MDC1Q14676 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MDC1Q14676 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MDC1Q14676 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MDC1Q14676 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MDC1Q14676 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MDC1Q14676 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MDC1Q14676 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MDC1Q14676 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MDC1Q14676 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MDC1Q14676 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MDC1Q14676 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MDC1Q14676 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MDC1Q14676 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MDC1Q14676 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MDC1Q14676 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MDC1Q14676 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MDC1Q14676 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MDC1Q14676 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MDC1Q14676 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MDC1Q14676 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MDC1Q14676 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MDC1Q14676 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MDC1Q14676 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MDC1Q14676 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MDC1Q14676 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MDC1Q14676 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MDC1Q14676 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MDC1Q14676 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MDC1Q14676 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MDC1Q14676 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MDC1Q14676 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MDC1Q14676 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MDC1Q14676 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MDC1Q14676 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MDC1Q14676 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MDC1Q14676 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MDC1Q14676 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MDC1Q14676 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MDC1Q14676 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MDC1Q14676 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MDC1Q14676 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
MDC1Q14676 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
MDC1Q14676 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MDC1Q14676 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MDC1Q14676 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MDC1Q14676 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MDC1Q14676 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
MDC1Q14676 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MDC1Q14676 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MDC1Q14676 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MDC1Q14676 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
MDC1Q14676 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MDC1Q14676 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MDC1Q14676 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
MDC1Q14676 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
MDC1Q14676 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
MDC1Q14676 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MDC1Q14676 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MDC1Q14676 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
MDC1Q14676 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
MDC1Q14676 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
MDC1Q14676 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MDC1Q14676 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MDC1Q14676 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MDC1Q14676 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MDC1Q14676 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MDC1Q14676 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MDC1Q14676 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MDC1Q14676 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MDC1Q14676 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MDC1Q14676 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MDC1Q14676 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MDC1Q14676 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MDC1Q14676 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
MDC1Q14676 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
MDC1Q14676 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
MDC1Q14676 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20■□□□□ 0.79
MDC1Q14676 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20■□□□□ 0.79
MDC1Q14676 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MDC1Q14676 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
MDC1Q14676 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
MDC1Q14676 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
MDC1Q14676 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
MDC1Q14676 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MDC1Q14676 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20■□□□□ 0.79
MDC1Q14676 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MDC1Q14676 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
MDC1Q14676 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MDC1Q14676 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MDC1Q14676 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MDC1Q14676 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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