Protein–RNA interactions for Protein: Q14590

ZNF235, Zinc finger protein 235, humanhuman

Predictions only

Length 738 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF235Q14590 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF235Q14590 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF235Q14590 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF235Q14590 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF235Q14590 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF235Q14590 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF235Q14590 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF235Q14590 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF235Q14590 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF235Q14590 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF235Q14590 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF235Q14590 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF235Q14590 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF235Q14590 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF235Q14590 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF235Q14590 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF235Q14590 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF235Q14590 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF235Q14590 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF235Q14590 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF235Q14590 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF235Q14590 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF235Q14590 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF235Q14590 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF235Q14590 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF235Q14590 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF235Q14590 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF235Q14590 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF235Q14590 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF235Q14590 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF235Q14590 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF235Q14590 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF235Q14590 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF235Q14590 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF235Q14590 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF235Q14590 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF235Q14590 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF235Q14590 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF235Q14590 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF235Q14590 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF235Q14590 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF235Q14590 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF235Q14590 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF235Q14590 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF235Q14590 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF235Q14590 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF235Q14590 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF235Q14590 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF235Q14590 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF235Q14590 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF235Q14590 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF235Q14590 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF235Q14590 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF235Q14590 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF235Q14590 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF235Q14590 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF235Q14590 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF235Q14590 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF235Q14590 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF235Q14590 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF235Q14590 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF235Q14590 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF235Q14590 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF235Q14590 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF235Q14590 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF235Q14590 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF235Q14590 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF235Q14590 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF235Q14590 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF235Q14590 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF235Q14590 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF235Q14590 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF235Q14590 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF235Q14590 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF235Q14590 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF235Q14590 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF235Q14590 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF235Q14590 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF235Q14590 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF235Q14590 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF235Q14590 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF235Q14590 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF235Q14590 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF235Q14590 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF235Q14590 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF235Q14590 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF235Q14590 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF235Q14590 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF235Q14590 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF235Q14590 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF235Q14590 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF235Q14590 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF235Q14590 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF235Q14590 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
ZNF235Q14590 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ZNF235Q14590 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF235Q14590 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF235Q14590 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF235Q14590 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF235Q14590 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
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