Protein–RNA interactions for Protein: Q14541

HNF4G, Hepatocyte nuclear factor 4-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF4GQ14541 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HNF4GQ14541 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HNF4GQ14541 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HNF4GQ14541 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HNF4GQ14541 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HNF4GQ14541 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HNF4GQ14541 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HNF4GQ14541 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HNF4GQ14541 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HNF4GQ14541 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HNF4GQ14541 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HNF4GQ14541 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HNF4GQ14541 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HNF4GQ14541 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HNF4GQ14541 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HNF4GQ14541 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HNF4GQ14541 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HNF4GQ14541 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HNF4GQ14541 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HNF4GQ14541 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HNF4GQ14541 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HNF4GQ14541 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HNF4GQ14541 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HNF4GQ14541 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HNF4GQ14541 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HNF4GQ14541 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HNF4GQ14541 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HNF4GQ14541 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HNF4GQ14541 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HNF4GQ14541 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HNF4GQ14541 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HNF4GQ14541 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HNF4GQ14541 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HNF4GQ14541 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HNF4GQ14541 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HNF4GQ14541 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HNF4GQ14541 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HNF4GQ14541 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HNF4GQ14541 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HNF4GQ14541 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HNF4GQ14541 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HNF4GQ14541 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HNF4GQ14541 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HNF4GQ14541 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HNF4GQ14541 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HNF4GQ14541 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HNF4GQ14541 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HNF4GQ14541 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HNF4GQ14541 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HNF4GQ14541 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HNF4GQ14541 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HNF4GQ14541 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HNF4GQ14541 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HNF4GQ14541 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HNF4GQ14541 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HNF4GQ14541 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HNF4GQ14541 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HNF4GQ14541 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HNF4GQ14541 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HNF4GQ14541 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HNF4GQ14541 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HNF4GQ14541 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HNF4GQ14541 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HNF4GQ14541 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HNF4GQ14541 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HNF4GQ14541 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HNF4GQ14541 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HNF4GQ14541 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HNF4GQ14541 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HNF4GQ14541 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HNF4GQ14541 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HNF4GQ14541 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HNF4GQ14541 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HNF4GQ14541 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HNF4GQ14541 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HNF4GQ14541 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HNF4GQ14541 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HNF4GQ14541 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HNF4GQ14541 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HNF4GQ14541 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HNF4GQ14541 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HNF4GQ14541 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HNF4GQ14541 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HNF4GQ14541 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
HNF4GQ14541 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
HNF4GQ14541 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HNF4GQ14541 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HNF4GQ14541 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HNF4GQ14541 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HNF4GQ14541 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HNF4GQ14541 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HNF4GQ14541 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HNF4GQ14541 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HNF4GQ14541 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HNF4GQ14541 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HNF4GQ14541 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HNF4GQ14541 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HNF4GQ14541 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HNF4GQ14541 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HNF4GQ14541 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
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