Protein–RNA interactions for Protein: Q14498

RBM39, RNA-binding protein 39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39Q14498 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RBM39Q14498 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RBM39Q14498 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RBM39Q14498 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
RBM39Q14498 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RBM39Q14498 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RBM39Q14498 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RBM39Q14498 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RBM39Q14498 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RBM39Q14498 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RBM39Q14498 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RBM39Q14498 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RBM39Q14498 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RBM39Q14498 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RBM39Q14498 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RBM39Q14498 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RBM39Q14498 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RBM39Q14498 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RBM39Q14498 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RBM39Q14498 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RBM39Q14498 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RBM39Q14498 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RBM39Q14498 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RBM39Q14498 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RBM39Q14498 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RBM39Q14498 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RBM39Q14498 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RBM39Q14498 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RBM39Q14498 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RBM39Q14498 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RBM39Q14498 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RBM39Q14498 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RBM39Q14498 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RBM39Q14498 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RBM39Q14498 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RBM39Q14498 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RBM39Q14498 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RBM39Q14498 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RBM39Q14498 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RBM39Q14498 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RBM39Q14498 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RBM39Q14498 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RBM39Q14498 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RBM39Q14498 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RBM39Q14498 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RBM39Q14498 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RBM39Q14498 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RBM39Q14498 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RBM39Q14498 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RBM39Q14498 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RBM39Q14498 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RBM39Q14498 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RBM39Q14498 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RBM39Q14498 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RBM39Q14498 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RBM39Q14498 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RBM39Q14498 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RBM39Q14498 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RBM39Q14498 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RBM39Q14498 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RBM39Q14498 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RBM39Q14498 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RBM39Q14498 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RBM39Q14498 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RBM39Q14498 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RBM39Q14498 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RBM39Q14498 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RBM39Q14498 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RBM39Q14498 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RBM39Q14498 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RBM39Q14498 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RBM39Q14498 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBM39Q14498 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBM39Q14498 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBM39Q14498 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBM39Q14498 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBM39Q14498 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBM39Q14498 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBM39Q14498 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBM39Q14498 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBM39Q14498 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBM39Q14498 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBM39Q14498 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBM39Q14498 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RBM39Q14498 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBM39Q14498 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBM39Q14498 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBM39Q14498 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBM39Q14498 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBM39Q14498 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBM39Q14498 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBM39Q14498 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBM39Q14498 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBM39Q14498 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBM39Q14498 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RBM39Q14498 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RBM39Q14498 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RBM39Q14498 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RBM39Q14498 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RBM39Q14498 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
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