Protein–RNA interactions for Protein: Q14406

CSHL1, Chorionic somatomammotropin hormone-like 1, humanhuman

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSHL1Q14406 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CSHL1Q14406 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CSHL1Q14406 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CSHL1Q14406 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CSHL1Q14406 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CSHL1Q14406 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CSHL1Q14406 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CSHL1Q14406 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CSHL1Q14406 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CSHL1Q14406 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CSHL1Q14406 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CSHL1Q14406 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CSHL1Q14406 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CSHL1Q14406 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CSHL1Q14406 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CSHL1Q14406 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CSHL1Q14406 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CSHL1Q14406 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CSHL1Q14406 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CSHL1Q14406 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CSHL1Q14406 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CSHL1Q14406 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CSHL1Q14406 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CSHL1Q14406 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CSHL1Q14406 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CSHL1Q14406 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CSHL1Q14406 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CSHL1Q14406 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CSHL1Q14406 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CSHL1Q14406 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CSHL1Q14406 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CSHL1Q14406 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CSHL1Q14406 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CSHL1Q14406 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CSHL1Q14406 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CSHL1Q14406 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CSHL1Q14406 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CSHL1Q14406 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CSHL1Q14406 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CSHL1Q14406 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CSHL1Q14406 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CSHL1Q14406 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CSHL1Q14406 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CSHL1Q14406 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CSHL1Q14406 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CSHL1Q14406 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CSHL1Q14406 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CSHL1Q14406 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CSHL1Q14406 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CSHL1Q14406 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CSHL1Q14406 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CSHL1Q14406 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CSHL1Q14406 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CSHL1Q14406 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CSHL1Q14406 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CSHL1Q14406 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CSHL1Q14406 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CSHL1Q14406 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CSHL1Q14406 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CSHL1Q14406 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CSHL1Q14406 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CSHL1Q14406 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CSHL1Q14406 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CSHL1Q14406 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CSHL1Q14406 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CSHL1Q14406 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CSHL1Q14406 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CSHL1Q14406 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CSHL1Q14406 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CSHL1Q14406 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CSHL1Q14406 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CSHL1Q14406 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
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CSHL1Q14406 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CSHL1Q14406 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CSHL1Q14406 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CSHL1Q14406 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CSHL1Q14406 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CSHL1Q14406 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CSHL1Q14406 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CSHL1Q14406 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CSHL1Q14406 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CSHL1Q14406 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CSHL1Q14406 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CSHL1Q14406 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CSHL1Q14406 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CSHL1Q14406 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CSHL1Q14406 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CSHL1Q14406 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CSHL1Q14406 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CSHL1Q14406 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CSHL1Q14406 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CSHL1Q14406 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CSHL1Q14406 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CSHL1Q14406 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CSHL1Q14406 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CSHL1Q14406 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CSHL1Q14406 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CSHL1Q14406 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CSHL1Q14406 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
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