Protein–RNA interactions for Protein: Q13829

TNFAIP1, BTB/POZ domain-containing adapter for CUL3-mediated RhoA degradation protein 2, humanhuman

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP1Q13829 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNFAIP1Q13829 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TNFAIP1Q13829 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNFAIP1Q13829 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNFAIP1Q13829 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNFAIP1Q13829 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNFAIP1Q13829 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNFAIP1Q13829 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TNFAIP1Q13829 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNFAIP1Q13829 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNFAIP1Q13829 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNFAIP1Q13829 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNFAIP1Q13829 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNFAIP1Q13829 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNFAIP1Q13829 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNFAIP1Q13829 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNFAIP1Q13829 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNFAIP1Q13829 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNFAIP1Q13829 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNFAIP1Q13829 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TNFAIP1Q13829 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNFAIP1Q13829 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNFAIP1Q13829 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNFAIP1Q13829 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNFAIP1Q13829 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNFAIP1Q13829 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNFAIP1Q13829 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TNFAIP1Q13829 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNFAIP1Q13829 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNFAIP1Q13829 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNFAIP1Q13829 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNFAIP1Q13829 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNFAIP1Q13829 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNFAIP1Q13829 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNFAIP1Q13829 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNFAIP1Q13829 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNFAIP1Q13829 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNFAIP1Q13829 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNFAIP1Q13829 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNFAIP1Q13829 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNFAIP1Q13829 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNFAIP1Q13829 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TNFAIP1Q13829 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNFAIP1Q13829 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TNFAIP1Q13829 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TNFAIP1Q13829 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNFAIP1Q13829 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNFAIP1Q13829 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNFAIP1Q13829 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNFAIP1Q13829 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNFAIP1Q13829 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNFAIP1Q13829 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNFAIP1Q13829 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNFAIP1Q13829 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNFAIP1Q13829 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNFAIP1Q13829 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
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TNFAIP1Q13829 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNFAIP1Q13829 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNFAIP1Q13829 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TNFAIP1Q13829 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNFAIP1Q13829 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNFAIP1Q13829 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNFAIP1Q13829 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNFAIP1Q13829 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNFAIP1Q13829 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNFAIP1Q13829 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNFAIP1Q13829 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNFAIP1Q13829 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNFAIP1Q13829 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNFAIP1Q13829 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNFAIP1Q13829 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNFAIP1Q13829 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNFAIP1Q13829 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNFAIP1Q13829 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNFAIP1Q13829 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNFAIP1Q13829 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNFAIP1Q13829 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNFAIP1Q13829 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNFAIP1Q13829 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNFAIP1Q13829 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNFAIP1Q13829 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNFAIP1Q13829 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNFAIP1Q13829 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNFAIP1Q13829 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNFAIP1Q13829 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNFAIP1Q13829 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TNFAIP1Q13829 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNFAIP1Q13829 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNFAIP1Q13829 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNFAIP1Q13829 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNFAIP1Q13829 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNFAIP1Q13829 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNFAIP1Q13829 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNFAIP1Q13829 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TNFAIP1Q13829 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNFAIP1Q13829 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNFAIP1Q13829 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNFAIP1Q13829 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNFAIP1Q13829 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
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