Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CACNA1SQ13698 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CACNA1SQ13698 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CACNA1SQ13698 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CACNA1SQ13698 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CACNA1SQ13698 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CACNA1SQ13698 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CACNA1SQ13698 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CACNA1SQ13698 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CACNA1SQ13698 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CACNA1SQ13698 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CACNA1SQ13698 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CACNA1SQ13698 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CACNA1SQ13698 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CACNA1SQ13698 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CACNA1SQ13698 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CACNA1SQ13698 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
CACNA1SQ13698 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CACNA1SQ13698 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CACNA1SQ13698 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CACNA1SQ13698 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CACNA1SQ13698 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CACNA1SQ13698 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CACNA1SQ13698 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CACNA1SQ13698 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CACNA1SQ13698 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CACNA1SQ13698 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CACNA1SQ13698 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CACNA1SQ13698 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CACNA1SQ13698 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CACNA1SQ13698 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CACNA1SQ13698 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CACNA1SQ13698 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CACNA1SQ13698 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CACNA1SQ13698 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CACNA1SQ13698 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CACNA1SQ13698 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CACNA1SQ13698 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CACNA1SQ13698 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CACNA1SQ13698 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CACNA1SQ13698 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CACNA1SQ13698 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CACNA1SQ13698 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CACNA1SQ13698 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CACNA1SQ13698 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CACNA1SQ13698 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
CACNA1SQ13698 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CACNA1SQ13698 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CACNA1SQ13698 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CACNA1SQ13698 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CACNA1SQ13698 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CACNA1SQ13698 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CACNA1SQ13698 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CACNA1SQ13698 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CACNA1SQ13698 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CACNA1SQ13698 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CACNA1SQ13698 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CACNA1SQ13698 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CACNA1SQ13698 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CACNA1SQ13698 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CACNA1SQ13698 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CACNA1SQ13698 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CACNA1SQ13698 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CACNA1SQ13698 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CACNA1SQ13698 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CACNA1SQ13698 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CACNA1SQ13698 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CACNA1SQ13698 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CACNA1SQ13698 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CACNA1SQ13698 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CACNA1SQ13698 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CACNA1SQ13698 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CACNA1SQ13698 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CACNA1SQ13698 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CACNA1SQ13698 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CACNA1SQ13698 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CACNA1SQ13698 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CACNA1SQ13698 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CACNA1SQ13698 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CACNA1SQ13698 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CACNA1SQ13698 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CACNA1SQ13698 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CACNA1SQ13698 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CACNA1SQ13698 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CACNA1SQ13698 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CACNA1SQ13698 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CACNA1SQ13698 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CACNA1SQ13698 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CACNA1SQ13698 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CACNA1SQ13698 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CACNA1SQ13698 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CACNA1SQ13698 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CACNA1SQ13698 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CACNA1SQ13698 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CACNA1SQ13698 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CACNA1SQ13698 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CACNA1SQ13698 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CACNA1SQ13698 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CACNA1SQ13698 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CACNA1SQ13698 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms