Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PMS2P11Q13670 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PMS2P11Q13670 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PMS2P11Q13670 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PMS2P11Q13670 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PMS2P11Q13670 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PMS2P11Q13670 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PMS2P11Q13670 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PMS2P11Q13670 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PMS2P11Q13670 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PMS2P11Q13670 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PMS2P11Q13670 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PMS2P11Q13670 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PMS2P11Q13670 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PMS2P11Q13670 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PMS2P11Q13670 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PMS2P11Q13670 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PMS2P11Q13670 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PMS2P11Q13670 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PMS2P11Q13670 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PMS2P11Q13670 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PMS2P11Q13670 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PMS2P11Q13670 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PMS2P11Q13670 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PMS2P11Q13670 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PMS2P11Q13670 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PMS2P11Q13670 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PMS2P11Q13670 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PMS2P11Q13670 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PMS2P11Q13670 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PMS2P11Q13670 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PMS2P11Q13670 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PMS2P11Q13670 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PMS2P11Q13670 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PMS2P11Q13670 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PMS2P11Q13670 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PMS2P11Q13670 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PMS2P11Q13670 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PMS2P11Q13670 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PMS2P11Q13670 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PMS2P11Q13670 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PMS2P11Q13670 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PMS2P11Q13670 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PMS2P11Q13670 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PMS2P11Q13670 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PMS2P11Q13670 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PMS2P11Q13670 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PMS2P11Q13670 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PMS2P11Q13670 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PMS2P11Q13670 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PMS2P11Q13670 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PMS2P11Q13670 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PMS2P11Q13670 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PMS2P11Q13670 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PMS2P11Q13670 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PMS2P11Q13670 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PMS2P11Q13670 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PMS2P11Q13670 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PMS2P11Q13670 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PMS2P11Q13670 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PMS2P11Q13670 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PMS2P11Q13670 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PMS2P11Q13670 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PMS2P11Q13670 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PMS2P11Q13670 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PMS2P11Q13670 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PMS2P11Q13670 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PMS2P11Q13670 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PMS2P11Q13670 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PMS2P11Q13670 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PMS2P11Q13670 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PMS2P11Q13670 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PMS2P11Q13670 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PMS2P11Q13670 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PMS2P11Q13670 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PMS2P11Q13670 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PMS2P11Q13670 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PMS2P11Q13670 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PMS2P11Q13670 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PMS2P11Q13670 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PMS2P11Q13670 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PMS2P11Q13670 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PMS2P11Q13670 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PMS2P11Q13670 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PMS2P11Q13670 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PMS2P11Q13670 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PMS2P11Q13670 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PMS2P11Q13670 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PMS2P11Q13670 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PMS2P11Q13670 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PMS2P11Q13670 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PMS2P11Q13670 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PMS2P11Q13670 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PMS2P11Q13670 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PMS2P11Q13670 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PMS2P11Q13670 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PMS2P11Q13670 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PMS2P11Q13670 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PMS2P11Q13670 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PMS2P11Q13670 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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