Protein–RNA interactions for Protein: Q13601

KRR1, KRR1 small subunit processome component homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRR1Q13601 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KRR1Q13601 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KRR1Q13601 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KRR1Q13601 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KRR1Q13601 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KRR1Q13601 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KRR1Q13601 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KRR1Q13601 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KRR1Q13601 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KRR1Q13601 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KRR1Q13601 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KRR1Q13601 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KRR1Q13601 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KRR1Q13601 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KRR1Q13601 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KRR1Q13601 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
KRR1Q13601 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KRR1Q13601 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KRR1Q13601 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KRR1Q13601 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KRR1Q13601 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KRR1Q13601 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KRR1Q13601 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KRR1Q13601 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KRR1Q13601 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KRR1Q13601 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KRR1Q13601 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KRR1Q13601 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KRR1Q13601 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KRR1Q13601 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KRR1Q13601 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KRR1Q13601 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KRR1Q13601 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KRR1Q13601 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KRR1Q13601 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KRR1Q13601 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KRR1Q13601 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KRR1Q13601 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KRR1Q13601 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KRR1Q13601 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KRR1Q13601 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KRR1Q13601 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KRR1Q13601 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KRR1Q13601 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KRR1Q13601 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KRR1Q13601 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
KRR1Q13601 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KRR1Q13601 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KRR1Q13601 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KRR1Q13601 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KRR1Q13601 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KRR1Q13601 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KRR1Q13601 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KRR1Q13601 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KRR1Q13601 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KRR1Q13601 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KRR1Q13601 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KRR1Q13601 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KRR1Q13601 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KRR1Q13601 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KRR1Q13601 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KRR1Q13601 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KRR1Q13601 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KRR1Q13601 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
KRR1Q13601 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KRR1Q13601 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KRR1Q13601 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KRR1Q13601 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KRR1Q13601 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KRR1Q13601 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KRR1Q13601 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KRR1Q13601 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KRR1Q13601 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KRR1Q13601 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KRR1Q13601 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KRR1Q13601 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KRR1Q13601 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KRR1Q13601 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KRR1Q13601 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KRR1Q13601 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KRR1Q13601 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KRR1Q13601 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KRR1Q13601 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KRR1Q13601 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
KRR1Q13601 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KRR1Q13601 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
KRR1Q13601 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KRR1Q13601 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KRR1Q13601 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KRR1Q13601 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KRR1Q13601 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KRR1Q13601 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KRR1Q13601 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KRR1Q13601 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KRR1Q13601 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KRR1Q13601 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KRR1Q13601 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KRR1Q13601 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KRR1Q13601 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KRR1Q13601 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
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