Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXE3Q13461 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXE3Q13461 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXE3Q13461 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXE3Q13461 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXE3Q13461 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXE3Q13461 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXE3Q13461 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXE3Q13461 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXE3Q13461 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXE3Q13461 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXE3Q13461 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXE3Q13461 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXE3Q13461 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXE3Q13461 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXE3Q13461 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXE3Q13461 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXE3Q13461 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXE3Q13461 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXE3Q13461 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXE3Q13461 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXE3Q13461 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXE3Q13461 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXE3Q13461 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXE3Q13461 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXE3Q13461 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXE3Q13461 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXE3Q13461 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXE3Q13461 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXE3Q13461 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXE3Q13461 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXE3Q13461 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXE3Q13461 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXE3Q13461 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXE3Q13461 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXE3Q13461 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXE3Q13461 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXE3Q13461 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXE3Q13461 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXE3Q13461 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXE3Q13461 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXE3Q13461 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXE3Q13461 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXE3Q13461 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXE3Q13461 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXE3Q13461 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXE3Q13461 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXE3Q13461 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXE3Q13461 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXE3Q13461 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXE3Q13461 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXE3Q13461 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXE3Q13461 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXE3Q13461 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXE3Q13461 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXE3Q13461 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXE3Q13461 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXE3Q13461 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXE3Q13461 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXE3Q13461 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXE3Q13461 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXE3Q13461 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXE3Q13461 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXE3Q13461 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXE3Q13461 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXE3Q13461 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXE3Q13461 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
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FOXE3Q13461 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXE3Q13461 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXE3Q13461 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXE3Q13461 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXE3Q13461 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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FOXE3Q13461 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXE3Q13461 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXE3Q13461 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXE3Q13461 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXE3Q13461 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXE3Q13461 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXE3Q13461 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXE3Q13461 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXE3Q13461 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXE3Q13461 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXE3Q13461 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXE3Q13461 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXE3Q13461 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXE3Q13461 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXE3Q13461 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXE3Q13461 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXE3Q13461 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXE3Q13461 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXE3Q13461 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXE3Q13461 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXE3Q13461 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXE3Q13461 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXE3Q13461 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXE3Q13461 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXE3Q13461 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
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