Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGB3BPQ13352 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGB3BPQ13352 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGB3BPQ13352 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGB3BPQ13352 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGB3BPQ13352 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGB3BPQ13352 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGB3BPQ13352 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGB3BPQ13352 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGB3BPQ13352 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGB3BPQ13352 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGB3BPQ13352 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGB3BPQ13352 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGB3BPQ13352 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGB3BPQ13352 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGB3BPQ13352 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGB3BPQ13352 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGB3BPQ13352 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ITGB3BPQ13352 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ITGB3BPQ13352 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ITGB3BPQ13352 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ITGB3BPQ13352 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ITGB3BPQ13352 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGB3BPQ13352 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGB3BPQ13352 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGB3BPQ13352 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGB3BPQ13352 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGB3BPQ13352 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGB3BPQ13352 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGB3BPQ13352 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGB3BPQ13352 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGB3BPQ13352 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGB3BPQ13352 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGB3BPQ13352 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGB3BPQ13352 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGB3BPQ13352 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGB3BPQ13352 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGB3BPQ13352 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGB3BPQ13352 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGB3BPQ13352 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGB3BPQ13352 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGB3BPQ13352 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGB3BPQ13352 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGB3BPQ13352 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGB3BPQ13352 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGB3BPQ13352 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGB3BPQ13352 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGB3BPQ13352 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGB3BPQ13352 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGB3BPQ13352 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGB3BPQ13352 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGB3BPQ13352 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGB3BPQ13352 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGB3BPQ13352 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGB3BPQ13352 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGB3BPQ13352 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGB3BPQ13352 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGB3BPQ13352 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGB3BPQ13352 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGB3BPQ13352 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGB3BPQ13352 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGB3BPQ13352 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGB3BPQ13352 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGB3BPQ13352 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGB3BPQ13352 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGB3BPQ13352 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGB3BPQ13352 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGB3BPQ13352 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGB3BPQ13352 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGB3BPQ13352 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGB3BPQ13352 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGB3BPQ13352 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGB3BPQ13352 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGB3BPQ13352 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGB3BPQ13352 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGB3BPQ13352 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGB3BPQ13352 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGB3BPQ13352 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGB3BPQ13352 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGB3BPQ13352 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGB3BPQ13352 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGB3BPQ13352 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGB3BPQ13352 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGB3BPQ13352 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGB3BPQ13352 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGB3BPQ13352 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGB3BPQ13352 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGB3BPQ13352 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGB3BPQ13352 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGB3BPQ13352 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGB3BPQ13352 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGB3BPQ13352 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGB3BPQ13352 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGB3BPQ13352 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGB3BPQ13352 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGB3BPQ13352 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGB3BPQ13352 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGB3BPQ13352 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGB3BPQ13352 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGB3BPQ13352 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
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