Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SP140Q13342 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SP140Q13342 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SP140Q13342 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SP140Q13342 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SP140Q13342 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SP140Q13342 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SP140Q13342 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SP140Q13342 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SP140Q13342 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SP140Q13342 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SP140Q13342 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SP140Q13342 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SP140Q13342 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SP140Q13342 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SP140Q13342 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SP140Q13342 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SP140Q13342 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SP140Q13342 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SP140Q13342 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SP140Q13342 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SP140Q13342 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SP140Q13342 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SP140Q13342 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SP140Q13342 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SP140Q13342 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SP140Q13342 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SP140Q13342 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SP140Q13342 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SP140Q13342 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SP140Q13342 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SP140Q13342 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SP140Q13342 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SP140Q13342 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SP140Q13342 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SP140Q13342 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SP140Q13342 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SP140Q13342 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SP140Q13342 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SP140Q13342 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SP140Q13342 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SP140Q13342 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SP140Q13342 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SP140Q13342 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SP140Q13342 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SP140Q13342 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SP140Q13342 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SP140Q13342 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SP140Q13342 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SP140Q13342 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SP140Q13342 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SP140Q13342 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SP140Q13342 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SP140Q13342 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SP140Q13342 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SP140Q13342 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SP140Q13342 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SP140Q13342 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SP140Q13342 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SP140Q13342 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SP140Q13342 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SP140Q13342 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SP140Q13342 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SP140Q13342 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SP140Q13342 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SP140Q13342 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SP140Q13342 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SP140Q13342 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SP140Q13342 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SP140Q13342 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SP140Q13342 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SP140Q13342 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SP140Q13342 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SP140Q13342 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SP140Q13342 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SP140Q13342 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SP140Q13342 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SP140Q13342 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SP140Q13342 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SP140Q13342 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SP140Q13342 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SP140Q13342 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SP140Q13342 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SP140Q13342 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SP140Q13342 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SP140Q13342 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SP140Q13342 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SP140Q13342 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SP140Q13342 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SP140Q13342 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SP140Q13342 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SP140Q13342 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SP140Q13342 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SP140Q13342 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SP140Q13342 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SP140Q13342 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SP140Q13342 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SP140Q13342 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SP140Q13342 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SP140Q13342 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
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