Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SRSF6Q13247 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SRSF6Q13247 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SRSF6Q13247 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SRSF6Q13247 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SRSF6Q13247 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SRSF6Q13247 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SRSF6Q13247 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SRSF6Q13247 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SRSF6Q13247 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SRSF6Q13247 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SRSF6Q13247 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SRSF6Q13247 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SRSF6Q13247 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SRSF6Q13247 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SRSF6Q13247 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SRSF6Q13247 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SRSF6Q13247 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SRSF6Q13247 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SRSF6Q13247 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SRSF6Q13247 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SRSF6Q13247 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SRSF6Q13247 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SRSF6Q13247 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SRSF6Q13247 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SRSF6Q13247 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SRSF6Q13247 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SRSF6Q13247 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SRSF6Q13247 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SRSF6Q13247 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SRSF6Q13247 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SRSF6Q13247 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SRSF6Q13247 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SRSF6Q13247 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SRSF6Q13247 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SRSF6Q13247 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SRSF6Q13247 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SRSF6Q13247 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SRSF6Q13247 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SRSF6Q13247 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SRSF6Q13247 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SRSF6Q13247 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SRSF6Q13247 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SRSF6Q13247 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SRSF6Q13247 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SRSF6Q13247 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SRSF6Q13247 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SRSF6Q13247 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SRSF6Q13247 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SRSF6Q13247 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SRSF6Q13247 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SRSF6Q13247 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SRSF6Q13247 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SRSF6Q13247 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SRSF6Q13247 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SRSF6Q13247 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SRSF6Q13247 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SRSF6Q13247 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SRSF6Q13247 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SRSF6Q13247 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SRSF6Q13247 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SRSF6Q13247 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SRSF6Q13247 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SRSF6Q13247 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
SRSF6Q13247 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SRSF6Q13247 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SRSF6Q13247 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SRSF6Q13247 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SRSF6Q13247 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SRSF6Q13247 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SRSF6Q13247 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SRSF6Q13247 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SRSF6Q13247 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SRSF6Q13247 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SRSF6Q13247 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SRSF6Q13247 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SRSF6Q13247 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SRSF6Q13247 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SRSF6Q13247 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SRSF6Q13247 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SRSF6Q13247 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SRSF6Q13247 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SRSF6Q13247 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SRSF6Q13247 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SRSF6Q13247 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SRSF6Q13247 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SRSF6Q13247 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SRSF6Q13247 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SRSF6Q13247 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SRSF6Q13247 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SRSF6Q13247 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SRSF6Q13247 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SRSF6Q13247 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SRSF6Q13247 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SRSF6Q13247 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SRSF6Q13247 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SRSF6Q13247 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SRSF6Q13247 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SRSF6Q13247 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SRSF6Q13247 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
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