Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

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Length 1,484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
GRIN2BQ13224 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
GRIN2BQ13224 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
GRIN2BQ13224 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
GRIN2BQ13224 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC34.79■■■■□ 3.16
GRIN2BQ13224 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
GRIN2BQ13224 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
GRIN2BQ13224 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
GRIN2BQ13224 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
GRIN2BQ13224 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
GRIN2BQ13224 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
GRIN2BQ13224 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
GRIN2BQ13224 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC34.78■■■■□ 3.16
GRIN2BQ13224 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
GRIN2BQ13224 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
GRIN2BQ13224 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
GRIN2BQ13224 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
GRIN2BQ13224 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
GRIN2BQ13224 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
GRIN2BQ13224 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
GRIN2BQ13224 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
GRIN2BQ13224 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
GRIN2BQ13224 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
GRIN2BQ13224 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
GRIN2BQ13224 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
GRIN2BQ13224 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
GRIN2BQ13224 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
GRIN2BQ13224 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
GRIN2BQ13224 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
GRIN2BQ13224 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
GRIN2BQ13224 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
GRIN2BQ13224 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
GRIN2BQ13224 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
GRIN2BQ13224 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
GRIN2BQ13224 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.16
GRIN2BQ13224 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.15
GRIN2BQ13224 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
GRIN2BQ13224 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.15
GRIN2BQ13224 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC34.76■■■■□ 3.15
GRIN2BQ13224 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
GRIN2BQ13224 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
GRIN2BQ13224 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
GRIN2BQ13224 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
GRIN2BQ13224 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
GRIN2BQ13224 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.75■■■■□ 3.15
GRIN2BQ13224 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
GRIN2BQ13224 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
GRIN2BQ13224 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
GRIN2BQ13224 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
GRIN2BQ13224 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.75■■■■□ 3.15
GRIN2BQ13224 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.75■■■■□ 3.15
GRIN2BQ13224 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
GRIN2BQ13224 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
GRIN2BQ13224 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
GRIN2BQ13224 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
GRIN2BQ13224 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
GRIN2BQ13224 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
GRIN2BQ13224 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
GRIN2BQ13224 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
GRIN2BQ13224 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
GRIN2BQ13224 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
GRIN2BQ13224 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
GRIN2BQ13224 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
GRIN2BQ13224 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
GRIN2BQ13224 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
GRIN2BQ13224 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
GRIN2BQ13224 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
GRIN2BQ13224 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
GRIN2BQ13224 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
GRIN2BQ13224 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
GRIN2BQ13224 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
GRIN2BQ13224 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
GRIN2BQ13224 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
GRIN2BQ13224 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
GRIN2BQ13224 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
GRIN2BQ13224 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
GRIN2BQ13224 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
GRIN2BQ13224 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
GRIN2BQ13224 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
GRIN2BQ13224 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
GRIN2BQ13224 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
GRIN2BQ13224 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
GRIN2BQ13224 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
GRIN2BQ13224 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
GRIN2BQ13224 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
GRIN2BQ13224 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
GRIN2BQ13224 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
GRIN2BQ13224 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
GRIN2BQ13224 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
GRIN2BQ13224 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
GRIN2BQ13224 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
GRIN2BQ13224 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
GRIN2BQ13224 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
GRIN2BQ13224 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
GRIN2BQ13224 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
GRIN2BQ13224 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
GRIN2BQ13224 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
GRIN2BQ13224 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC34.7■■■■□ 3.15
GRIN2BQ13224 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC34.7■■■■□ 3.15
GRIN2BQ13224 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC34.7■■■■□ 3.15
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